More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12770 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12770  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 336 aa  648    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.348945  normal  0.0208178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  55.29 
 
 		 308 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  54.63 
 
 		 337 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  52.85 
 
 		 311 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  52.11 
 
 		 309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  56.62 
 
 		 319 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1722  methionyl-tRNA formyltransferase  56.02 
 
 		 318 aa  308  9e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000240612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  53.35 
 
 		 307 aa  308  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  53.89 
 
 		 315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  53.59 
 
 		 310 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  52.87 
 
 		 308 aa  305  8.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  52.6 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  52.57 
 
 		 310 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  52.78 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  52.28 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  52.57 
 
 		 308 aa  299  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  53.61 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  49.41 
 
 		 315 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  53.07 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  53.07 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0196795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  53.07 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2687  methionyl-tRNA formyltransferase  52.13 
 
 		 310 aa  289  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2350  methionyl-tRNA formyltransferase  51.81 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  50.62 
 
 		 306 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  53.19 
 
 		 311 aa  285  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  52.63 
 
 		 309 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  49.7 
 
 		 316 aa  285  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  52.48 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3730  methionyl-tRNA formyltransferase  52.6 
 
 		 310 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.132882  normal  0.0191381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11435  methionyl-tRNA formyltransferase  50.61 
 
 		 312 aa  275  7e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.682601  normal  0.406209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  48.05 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2567  methionyl-tRNA formyltransferase  51.8 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296174  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  49.7 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  46.83 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1966  methionyl-tRNA formyltransferase  45.76 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  47.42 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10800  methionyl-tRNA formyltransferase  44.16 
 
 		 366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0126989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0143  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0856282  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  43.75 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  42.15 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  43.25 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  39.02 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  40.74 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  41.69 
 
 		 307 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  40 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  41.74 
 
 		 310 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  39.64 
 
 		 320 aa  195  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  47.08 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  41.01 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.38 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  40.31 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  39.69 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  41.25 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  46.46 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  38.2 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0054  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  39.38 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04056  methionyl-tRNA formyltransferase  45.28 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  39.46 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  41.19 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  43.3 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0178  methionyl-tRNA formyltransferase  40.38 
 
 		 314 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  32.82 
 
 		 314 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  32.82 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  39.13 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  40.49 
 
 		 309 aa  189  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  39.31 
 
 		 319 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000109798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0067  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.196453  unclonable  0.000000439837 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  31.64 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  32 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  32 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  32 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  32 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417966  decreased coverage  0.00000000000000611556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  41.03 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.107334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  32 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  37.65 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  31.93 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0083  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2040  methionyl-tRNA formyltransferase  38.46 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0016  methionyl-tRNA formyltransferase  35.93 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.982881  normal  0.112275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  37.35 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3851  methionyl-tRNA formyltransferase  34.6 
 
 		 333 aa  186  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  32.21 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  31.69 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  37.19 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  32.72 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>