More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  58.9 
 
 		 240 aa  254  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  57.94 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  60.83 
 
 		 268 aa  238  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  58.56 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  58.74 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  56.19 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  58.41 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  58.3 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  62.1 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  59.17 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  58.42 
 
 		 249 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  53.1 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  61.76 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  57.77 
 
 		 276 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  52.7 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  53.42 
 
 		 239 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  49.78 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  52.91 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  61.75 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  58.18 
 
 		 250 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  54.26 
 
 		 235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  56.67 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  59.07 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  57.59 
 
 		 270 aa  210  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  50.22 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  51.12 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  51.12 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  54.9 
 
 		 249 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  58.42 
 
 		 270 aa  205  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  50.23 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  50.72 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  51.18 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  52 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  52 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  52 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  47.3 
 
 		 230 aa  187  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  48.34 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  46.64 
 
 		 242 aa  184  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  49.76 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  43.75 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  45.79 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  40.36 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  44.08 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  41.26 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.91 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  43.64 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  44.44 
 
 		 235 aa  168  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  49.29 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  43.81 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  45.62 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  43.44 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  47.47 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  42.08 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  40.89 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  45.97 
 
 		 383 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  43.24 
 
 		 377 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  39.81 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  39.81 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  42.08 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.15 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  45.97 
 
 		 383 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  40.35 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  41.18 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  37.9 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5261  ribonuclease III  43.36 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48838  normal  0.851553 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  40.38 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  37.9 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  40.38 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2620  ribonuclease III  46.35 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  45.02 
 
 		 385 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3267  ribonuclease III  46.35 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0395589 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  39.81 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  39.71 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  39.81 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  41.44 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  43.66 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  40.97 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  38.46 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  42.48 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1742  ribonuclease III  39.09 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  37.95 
 
 		 253 aa  148  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1081  ribonuclease III  40.95 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  45.66 
 
 		 262 aa  148  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  40.79 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2086  ribonuclease III  46.67 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  45.23 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  38.57 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  39.73 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3854  ribonuclease III  43.17 
 
 		 258 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  38.89 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2039  ribonuclease III  40.76 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.875758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  41.85 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  41.85 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  41.9 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  40.48 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  37.98 
 
 		 223 aa  143  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  41.85 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  40.81 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  41.85 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>