More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  100 
 
 		 251 aa  490  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  53.85 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  53.49 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  52.03 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  52.87 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  51.78 
 
 		 273 aa  232  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  51.28 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  51.28 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  51.28 
 
 		 237 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  51.5 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  51.48 
 
 		 244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  50.63 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  49.79 
 
 		 269 aa  218  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  48.94 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  50.64 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  52.14 
 
 		 258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  50.83 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  52.28 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  51.22 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  53.5 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  51.61 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  48.79 
 
 		 243 aa  207  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  48.74 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  48.74 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  48.97 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  52.34 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  49.79 
 
 		 246 aa  205  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  52.32 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  47.48 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  51.06 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  52.1 
 
 		 260 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  45.99 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  51.48 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  43.28 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  42.28 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  44.63 
 
 		 262 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  42.91 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  39.76 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  46.38 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  47.56 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  36.33 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  46.89 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  43.08 
 
 		 265 aa  184  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  42.74 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  47.28 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  38.52 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  42.56 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  39.06 
 
 		 259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  47.06 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  46.41 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  39.83 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  42.25 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  39.13 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  39.08 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  43.1 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  40.68 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  35.22 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  34.45 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  34.87 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  36.91 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  35.29 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  39.68 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  39.68 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  39.27 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  39.68 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  39.68 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  39.68 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  39.68 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  39.68 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  35.74 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  41.67 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  36.32 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  41.55 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  39.75 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  35.59 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  40.51 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  36.96 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  36.61 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  37.6 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  38.4 
 
 		 263 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  42.51 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  40.85 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  40.76 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  38.46 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  33.6 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  30.17 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  36.51 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  41.32 
 
 		 232 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  32.91 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  37.97 
 
 		 248 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>