More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0987 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 224 aa  434  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  49.09 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  48.18 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  48.23 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  48.76 
 
 		 203 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  46.23 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  40.29 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  43.28 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  43.28 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  43.28 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  41.35 
 
 		 421 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  44.39 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  39.01 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 374 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 443 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  31.84 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  36.04 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  35.84 
 
 		 584 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.36 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  41.98 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.62 
 
 		 356 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 440 aa  65.1  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.7 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.7 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.7 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  23.15 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  44.19 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  23.65 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  45.35 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  45.35 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  45.35 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 412 aa  61.6  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  37.34 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  44.71 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  42.17 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.47 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  32.47 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35.98 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  32.47 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  32.47 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  32.47 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  32.47 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  25.51 
 
 		 452 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  38.95 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.05 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.56 
 
 		 382 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.65 
 
 		 452 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  30.48 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.08 
 
 		 427 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  42.35 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  31.82 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  32.69 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>