More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0599 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0599  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 307 aa  591  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.404846  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4995  HhH-GPD family protein  70.82 
 
 		 291 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0246379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  70.21 
 
 		 291 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4471  HhH-GPD family protein  69.26 
 
 		 296 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3414  HhH-GPD family protein  68.88 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9146  A/G-specific DNA glycosylase-like protein  67.72 
 
 		 291 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0467  HhH-GPD family protein  63.29 
 
 		 288 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.31103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  63.07 
 
 		 310 aa  329  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35330  A/G-specific DNA glycosylase  61.75 
 
 		 293 aa  328  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12933  normal  0.479068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0357  HhH-GPD family protein  63.29 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  0.0136889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  62.85 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0343  HhH-GPD family protein  61.29 
 
 		 329 aa  318  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24580  A/G-specific DNA glycosylase  63.44 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  60.61 
 
 		 313 aa  318  7.999999999999999e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  61.07 
 
 		 299 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4260  HhH-GPD  60.47 
 
 		 320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.931254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  61.79 
 
 		 299 aa  309  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0177  HhH-GPD family protein  57.63 
 
 		 347 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0341  HhH-GPD family protein  60.46 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  59.45 
 
 		 303 aa  301  9e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0642  HhH-GPD family protein  61.62 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0963  HhH-GPD family protein  55.59 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.313927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5346  HhH-GPD family protein  58.36 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0860  HhH-GPD family protein  61.35 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5132  HhH-GPD family protein  56.94 
 
 		 288 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4746  HhH-GPD  56.94 
 
 		 288 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4832  HhH-GPD family protein  56.94 
 
 		 288 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13622  adenine glycosylase mutY  54.88 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.23263e-43  normal  0.044333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06850  A/G-specific DNA glycosylase  56.25 
 
 		 313 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  55.23 
 
 		 285 aa  276  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0595  HhH-GPD family protein  55.25 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1102  HhH-GPD family protein  53.96 
 
 		 300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0221  HhH-GPD family protein  57.04 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230318  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1438  HhH-GPD family protein  57.6 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  57.79 
 
 		 581 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  52.76 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0967  A/G-specific DNA glycosylase  44.06 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.82 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  44.27 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  41.85 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  47.78 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  39.73 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  39 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  40.83 
 
 		 354 aa  159  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  42.65 
 
 		 357 aa  159  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  43.56 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  41.05 
 
 		 368 aa  159  8e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  40.93 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  41.74 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.2 
 
 		 372 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  35.55 
 
 		 368 aa  155  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  44.72 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  38.98 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.74 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  40.74 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  40.74 
 
 		 363 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  40.74 
 
 		 363 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000495773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  34.98 
 
 		 344 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0748  A/G-specific adenine glycosylase  43.78 
 
 		 383 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  40.74 
 
 		 363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  43.59 
 
 		 376 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  41.01 
 
 		 362 aa  152  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4690  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.93 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.036705  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  36.27 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  40.65 
 
 		 388 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  41.86 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  38.06 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.9 
 
 		 345 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.28 
 
 		 372 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  39.15 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  39.15 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  39.15 
 
 		 360 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  39.15 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  39.15 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  39.15 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3394  adenine DNA glycosylase  37.65 
 
 		 360 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0960  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  47.84 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.446889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1600  A/G-specific adenine glycosylase  45.02 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.23 
 
 		 361 aa  149  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.36 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  42.42 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  39.61 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  38.53 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  38.72 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  40.37 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  38.05 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  41.43 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.173815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  39.57 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3453  adenine DNA glycosylase  39.57 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849569 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3284  adenine DNA glycosylase  39.57 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0228526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3350  adenine DNA glycosylase  39.32 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.443349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1219  A/G-specific adenine glycosylase  40.28 
 
 		 370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000411331  normal  0.458065 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  31.65 
 
 		 386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  37.22 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2873  A/G-specific adenine glycosylase  41.26 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  39.22 
 
 		 350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3227  A/G-specific adenine glycosylase  43.08 
 
 		 392 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599367  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.5 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>