More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0295 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
306 aa  614  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18860  carbohydrate ABC transporter membrane protein  64.71 
 
 
316 aa  353  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.346815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.5 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal  0.200389 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.77 
 
 
311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.82 
 
 
320 aa  282  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.82 
 
 
316 aa  280  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29890  carbohydrate ABC transporter membrane protein  50.7 
 
 
333 aa  276  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12850  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpA  50.17 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170243  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
311 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.51 
 
 
306 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
318 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.149292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
303 aa  218  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.013229  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
352 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.72 
 
 
319 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172357  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
292 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
316 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  39.57 
 
 
307 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
307 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.16 
 
 
293 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.199959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30860  permease component of ABC-type sugar transporter  39.58 
 
 
350 aa  186  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
293 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0106698  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.14 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161235  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0963268  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3284  maltose-binding periplasmic protein  38.98 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588261  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1265  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  37.37 
 
 
293 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 
293 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
294 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3289  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpA  37.97 
 
 
293 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  39.93 
 
 
305 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  36.27 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0656  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  37.02 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.27 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0618  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  37.02 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.87 
 
 
310 aa  178  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 
310 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.11 
 
 
320 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.92 
 
 
310 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
308 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.87 
 
 
310 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
307 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  33.55 
 
 
310 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
312 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  33.55 
 
 
310 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
297 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
293 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 
301 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
304 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0348  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.412019  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
293 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
316 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
292 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.01 
 
 
287 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.61 
 
 
293 aa  168  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
293 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
298 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.84 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0112  putative sugar ABC transporter (permease protein)  35.44 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
299 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
293 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
293 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
293 aa  166  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
294 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.53764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
293 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.84 
 
 
354 aa  165  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  32.88 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06397  hypothetical protein  38.27 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.16436  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3961  glycerol-3-phosphate transporter permease  34.03 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0257  glycerol-3-phosphate transporter permease  34.03 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2094  sn-glycerol-3-phosphate transport system, binding protein inner membrane component  37.65 
 
 
293 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236232  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
293 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0126  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.64 
 
 
295 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  33.02 
 
 
322 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
305 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.661532 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3654  glycerol-3-phosphate transporter permease  33.68 
 
 
295 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.702231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0235  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.76 
 
 
295 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
308 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
290 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00066862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
313 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.86 
 
 
314 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  32.86 
 
 
314 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
313 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
315 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0566553  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0118  glycerol-3-phosphate transporter permease  33.68 
 
 
295 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
309 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
292 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>