More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0861 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.66 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.45 
 
 
293 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.43 
 
 
293 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.5 
 
 
301 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.06 
 
 
293 aa  447  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.43 
 
 
293 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.89 
 
 
293 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0963268  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.89 
 
 
293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0106698  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1265  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  65.87 
 
 
293 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.24 
 
 
293 aa  398  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  67.92 
 
 
293 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.51 
 
 
294 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572034  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3725  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  64.51 
 
 
322 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119738  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3020  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  64.16 
 
 
319 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.51 
 
 
294 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.51 
 
 
313 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3696  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  64.51 
 
 
322 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3493  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  64.16 
 
 
294 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.51 
 
 
294 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  0.0342542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0447  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  64.16 
 
 
294 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.82 
 
 
313 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3210  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  64.51 
 
 
294 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0692597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1761  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  64.51 
 
 
294 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3754  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  64.51 
 
 
294 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2793  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  64.51 
 
 
294 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.48 
 
 
294 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691644  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.48 
 
 
294 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.14 
 
 
294 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.48 
 
 
293 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.16436  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0126  glycerol-3-phosphate transporter permease  61.3 
 
 
295 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06397  hypothetical protein  62.46 
 
 
293 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0235  glycerol-3-phosphate transporter permease  62.33 
 
 
295 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0118  glycerol-3-phosphate transporter permease  62.33 
 
 
295 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2015  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein  61.43 
 
 
293 aa  363  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.960254  normal  0.0166365 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2094  sn-glycerol-3-phosphate transport system, binding protein inner membrane component  60.41 
 
 
293 aa  361  9e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236232  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3961  glycerol-3-phosphate transporter permease  62.54 
 
 
295 aa  358  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0257  glycerol-3-phosphate transporter permease  62.54 
 
 
295 aa  358  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3654  glycerol-3-phosphate transporter permease  62.2 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.702231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.1 
 
 
292 aa  350  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3284  maltose-binding periplasmic protein  58.76 
 
 
293 aa  349  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588261  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0656  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  58.76 
 
 
293 aa  347  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.42 
 
 
293 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0618  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  58.76 
 
 
293 aa  347  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03301  glycerol-3-phosphate transporter subunit  60.27 
 
 
295 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.27 
 
 
295 aa  346  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03254  hypothetical protein  60.27 
 
 
295 aa  346  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3289  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpA  58.42 
 
 
293 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3649  glycerol-3-phosphate transporter permease  60.27 
 
 
295 aa  346  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0264  glycerol-3-phosphate transporter permease  60.27 
 
 
295 aa  346  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.332041  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3758  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.59 
 
 
295 aa  345  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3868  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.59 
 
 
295 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3825  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.59 
 
 
295 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3927  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.59 
 
 
295 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.961515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.72 
 
 
292 aa  345  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161235  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.25 
 
 
294 aa  345  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.53764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3871  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.93 
 
 
295 aa  344  8e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3731  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.93 
 
 
295 aa  344  8e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3930  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.93 
 
 
295 aa  344  8.999999999999999e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3747  glycerol-3-phosphate transporter permease  60 
 
 
295 aa  344  8.999999999999999e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4766  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.59 
 
 
295 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  0.380759 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.04 
 
 
293 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.199959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0112  putative sugar ABC transporter (permease protein)  60.07 
 
 
293 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.02 
 
 
293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.76 
 
 
293 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.412019  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.42 
 
 
293 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.36 
 
 
304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0348  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  53.77 
 
 
294 aa  326  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3855  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.25 
 
 
295 aa  325  8.000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.601717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.02 
 
 
293 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.37 
 
 
294 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.96 
 
 
294 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3860  glycerol-3-phosphate transporter permease  60.14 
 
 
295 aa  315  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57 
 
 
293 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4044  glycerol-3-phosphate transporter permease  59.79 
 
 
295 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.61 
 
 
294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.580675  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.1 
 
 
292 aa  299  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1696  hypothetical protein  51.07 
 
 
292 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1695  hypothetical protein  50.36 
 
 
292 aa  290  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.19 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1156  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  49.49 
 
 
293 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
322 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.518821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.73 
 
 
294 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.890254  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
293 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0202673  normal  0.352702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
294 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0356  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  45.02 
 
 
293 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.584093  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.967188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
290 aa  211  9e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00066862  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
316 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141538  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5506  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  38.26 
 
 
296 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
288 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
296 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.0551822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0663  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  37.64 
 
 
297 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.978604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  34.04 
 
 
310 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.04 
 
 
310 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
310 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
310 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.33 
 
 
310 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
310 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>