More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2663 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
316 aa  614  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
292 aa  235  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161235  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1265  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  41.39 
 
 
293 aa  229  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
288 aa  229  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.967188  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
293 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0963268  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
293 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0106698  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
293 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
293 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
293 aa  225  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
293 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.42 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.58 
 
 
293 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.199959 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0348  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.67 
 
 
294 aa  219  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
293 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3284  maltose-binding periplasmic protein  41.86 
 
 
293 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588261  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3289  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpA  41.86 
 
 
293 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
293 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
293 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
292 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
313 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0656  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
293 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0618  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
293 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.94 
 
 
294 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  0.0342542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3725  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.74 
 
 
322 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3493  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 
294 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
288 aa  208  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
301 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0112  putative sugar ABC transporter (permease protein)  40.27 
 
 
293 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
294 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572034  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
290 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00066862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3020  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 
319 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0447  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.6 
 
 
294 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
294 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3210  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
294 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0692597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1761  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
294 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3696  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  39.4 
 
 
322 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3754  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  39.8 
 
 
294 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2793  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.8 
 
 
294 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
293 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
294 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691644  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
294 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
313 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
294 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.53764 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06397  hypothetical protein  38.23 
 
 
293 aa  205  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
293 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
294 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 
293 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.412019  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
304 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2094  sn-glycerol-3-phosphate transport system, binding protein inner membrane component  37.25 
 
 
293 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236232  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0126  glycerol-3-phosphate transporter permease  38.38 
 
 
295 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2015  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein  40.4 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.960254  normal  0.0166365 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
293 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.16436  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.518821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0235  glycerol-3-phosphate transporter permease  38.26 
 
 
295 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.93 
 
 
290 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.978604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0118  glycerol-3-phosphate transporter permease  38.67 
 
 
295 aa  192  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
302 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
293 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
292 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1695  hypothetical protein  36.3 
 
 
292 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
294 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1696  hypothetical protein  35.96 
 
 
292 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3758  glycerol-3-phosphate transporter permease  36.7 
 
 
295 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3927  glycerol-3-phosphate transporter permease  36.7 
 
 
295 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.961515 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3868  glycerol-3-phosphate transporter permease  36.7 
 
 
295 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3825  glycerol-3-phosphate transporter permease  36.7 
 
 
295 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3747  glycerol-3-phosphate transporter permease  36.95 
 
 
295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3654  glycerol-3-phosphate transporter permease  37.16 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.702231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3961  glycerol-3-phosphate transporter permease  37.16 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0257  glycerol-3-phosphate transporter permease  37.16 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3731  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.69 
 
 
295 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03301  glycerol-3-phosphate transporter subunit  35.69 
 
 
295 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
295 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0264  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.69 
 
 
295 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.332041  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03254  hypothetical protein  35.69 
 
 
295 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3649  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.69 
 
 
295 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
306 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3930  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.69 
 
 
295 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3871  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.35 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4766  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.35 
 
 
295 aa  180  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  0.380759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0356  ABC transporter membrane spanning protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  36.45 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.584093  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
308 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3860  glycerol-3-phosphate transporter permease  37.79 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
297 aa  172  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.654784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.15 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  33.45 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  33.8 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  33.8 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.8 
 
 
310 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 
310 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3855  glycerol-3-phosphate transporter permease  35.79 
 
 
295 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.601717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 
310 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
318 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.8 
 
 
310 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1156  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  37.67 
 
 
293 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>