More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3656 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3656  ABC transporter related  100 
 
 		 219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.340001  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1235  ABC transporter related  77.67 
 
 		 217 aa  360  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000953894  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0655  ABC transporter related  73.97 
 
 		 219 aa  354  3.9999999999999996e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0585  capsule polysaccharide export  73.15 
 
 		 219 aa  332  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5954  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2582  ABC transporter related  42.52 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000122652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2730  ABC transporter related  38.5 
 
 		 216 aa  167  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0774  ABC transporter related  39.44 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0815  ABC transporter related  39.44 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1659  ABC transporter related  38.99 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0434  ABC transporter related  38.99 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554012  decreased coverage  0.00307291 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4084  ABC transporter related  38.81 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185467  normal  0.229237 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3839  ABC polysaccharide export transporter, ATPase subunit  38.81 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00536302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1335  BexA  39.63 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0736  ABC transporter related  38.97 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0841853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3867  ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5580  ABC transporter related  37.56 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.819808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1152  ABC transporter related  38.03 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0292  ABC transporter related  38.36 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0776  ABC transporter related  38.36 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3811  ABC transporter related  37.2 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2077  ABC transporter related  36.84 
 
 		 220 aa  151  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.475401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2344  ABC transporter related  38.5 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4995  ABC transporter related  33.64 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0209263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001783  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  36.62 
 
 		 217 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0712  cell surface polysaccharide export ABC-2 transporter ATP-binding protein  37.56 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1524  ABC transporter related  35.48 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2758  ABC transporter related  31.96 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3903  ABC transporter related  32.72 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.106958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0623  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  34.72 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3493  ABC transporter related  34.7 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2576  ABC transporter related  35.19 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.502206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2963  capsule polysaccharide exporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.382388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3239  ABC transporter related  34.11 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1505  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2304  capsule polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2182  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3251  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1075  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02776  hypothetical protein  33.66 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000456764  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2127  ABC transporter related  32.57 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5037  ABC transporter related  32.57 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0291  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02827  Polysialic acid transport ATP-binding KpsT  34.17 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1781  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0748  ABC transporter related  34.45 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0720  ABC transporter related  35.32 
 
 		 215 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3234  polysialic acid capsule biosynthesis transport protein KpsT  33.65 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.953201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0660  ABC transporter related  36.06 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.188715  normal  0.0364209 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0745  ABC transporter related  34.25 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2607  ABC transporter related  31.82 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4077  ABC transporter related  29.67 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0433978 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1620  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 220 aa  127  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1440  capsular polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 220 aa  127  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1305  polysialic acid transport ATP-binding protein  33.49 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03060  KpsT protein  31.63 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3995  hypothetical protein  35.71 
 
 		 179 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.67953  normal  0.524106 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5731  polysialic acid transport ATP-binding protein KpsT  32.26 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4940  ATPase component ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system  30.36 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0520  ABC transporter related  30.77 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940922  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  34.02 
 
 		 437 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  31.4 
 
 		 405 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0432  ABC transporter related  31.28 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  31.86 
 
 		 242 aa  98.6  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  32.51 
 
 		 406 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  30.39 
 
 		 394 aa  97.8  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  30.43 
 
 		 405 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  31.13 
 
 		 438 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  28.5 
 
 		 254 aa  96.3  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  29.95 
 
 		 260 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  27.78 
 
 		 261 aa  96.3  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  29.67 
 
 		 435 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  33.16 
 
 		 402 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0292  ABC transporter related  28.63 
 
 		 320 aa  95.9  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.274701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  28.85 
 
 		 440 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  33.15 
 
 		 424 aa  95.1  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0524  capsular polysaccharide export ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 		 157 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.216602  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  29.29 
 
 		 455 aa  94.7  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3014  ABC transporter related  31.25 
 
 		 238 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0480496  hitchhiker  0.000194399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  28.86 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  30.35 
 
 		 456 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  31.43 
 
 		 433 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  30.88 
 
 		 416 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  27.78 
 
 		 264 aa  93.6  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  29.49 
 
 		 429 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  32.11 
 
 		 436 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  31.61 
 
 		 424 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  30.96 
 
 		 253 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  26.94 
 
 		 498 aa  92.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  29.27 
 
 		 415 aa  92.4  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3964  ABC transporter related  29.2 
 
 		 416 aa  92  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  30.57 
 
 		 328 aa  92  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  31.52 
 
 		 428 aa  91.7  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  31.82 
 
 		 420 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  32.07 
 
 		 605 aa  90.9  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 		 393 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 		 393 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  28.64 
 
 		 296 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  31.44 
 
 		 429 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>