123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2844 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
547 aa  1074    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  58.76 
 
 
496 aa  515  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3244  phosphoesterase RecJ domain protein  48.07 
 
 
516 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1106  phosphoesterase RecJ domain protein  48.97 
 
 
513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  47.08 
 
 
478 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0367  hypothetical protein  39.29 
 
 
488 aa  293  6e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  39.12 
 
 
498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1773  TrkA-N domain protein  38.89 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2387  TrkA-N domain protein  38.3 
 
 
483 aa  273  6e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.594863  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0397  TrkA domain-containing protein  36.7 
 
 
500 aa  264  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.377542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0754  hypothetical protein  36.07 
 
 
497 aa  264  4e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.452163  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0397  TrkA-N domain protein  38.43 
 
 
485 aa  263  8e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0616  TrkA-N  37.26 
 
 
487 aa  259  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.884731  normal  0.130775 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  44.8 
 
 
374 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1641  phosphoesterase RecJ domain protein  37.05 
 
 
484 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  35.94 
 
 
474 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0490  phosphoesterase RecJ domain protein  43.77 
 
 
339 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.59625 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2275  TrkA domain-containing protein  43.3 
 
 
489 aa  252  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.313636 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  41.85 
 
 
511 aa  247  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3473  TrkA-N domain protein  35.16 
 
 
482 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.208295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1927  phosphoesterase RecJ domain protein  42.38 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  37.58 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  35.54 
 
 
486 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  35.26 
 
 
486 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  36.73 
 
 
487 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0595  phosphoesterase RecJ domain protein  40.38 
 
 
423 aa  211  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1345  phosphoesterase RecJ domain protein  39.1 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  38.87 
 
 
399 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  36.91 
 
 
389 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1197  phosphoesterase RecJ domain protein  36.63 
 
 
396 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0927845  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  35.29 
 
 
391 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1931  phosphoesterase RecJ domain protein  35.37 
 
 
346 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1049  phosphoesterase, RecJ-like  31.75 
 
 
368 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1105  phosphoesterase RecJ domain protein  31.75 
 
 
374 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1176  phosphoesterase RecJ domain protein  31.75 
 
 
374 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2032  hypothetical protein  33.23 
 
 
349 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2292  phosphoesterase RecJ domain protein  34.27 
 
 
346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1099  phosphoesterase domain-containing protein  31.96 
 
 
375 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4087  hypothetical protein  33.04 
 
 
408 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0370  phosphoesterase domain-containing protein  31.01 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2757  hypothetical protein  31.81 
 
 
420 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1319  phosphoesterase RecJ domain protein  31.98 
 
 
420 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.195797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1292  phosphoesterase RecJ domain protein  31.69 
 
 
420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0526  phosphoesterase domain-containing protein  32.84 
 
 
393 aa  133  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0410  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  34.36 
 
 
429 aa  133  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2676  phosphoesterase, RecJ-like  33.56 
 
 
427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0851  phosphoesterase domain-containing protein  29.47 
 
 
351 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2403  phosphoesterase RecJ domain protein  33.22 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.87719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1796  DHH family protein  32.96 
 
 
366 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00640097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3494  DHH family protein  32.51 
 
 
346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1755  phosphoesterase RecJ domain protein  30.91 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2314  phosphoesterase domain-containing protein  29.25 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3124  phosphoesterase RecJ domain protein  31.21 
 
 
341 aa  128  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1877  phosphoesterase, RecJ-like  30.19 
 
 
360 aa  127  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000033768  hitchhiker  0.00303218 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2480  phosphoesterase domain-containing protein  31.18 
 
 
335 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0641  phosphoesterase domain-containing protein  27.63 
 
 
335 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323169  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0342  phosphoesterase RecJ domain protein  30.74 
 
 
347 aa  120  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0517686  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0027  DHH superfamily protein, subfamily 1  30.99 
 
 
327 aa  109  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  25.68 
 
 
672 aa  63.9  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  25.83 
 
 
652 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  25.74 
 
 
652 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  26.48 
 
 
684 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  27.5 
 
 
658 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  27.55 
 
 
658 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  27.24 
 
 
669 aa  60.5  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
877 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  26.96 
 
 
888 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2755  CBS domain-containing protein  27.45 
 
 
896 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.1635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1184  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.75 
 
 
905 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  28.01 
 
 
880 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.12 
 
 
821 aa  57  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  29.76 
 
 
769 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.6 
 
 
892 aa  56.2  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0788  signal protein  26.5 
 
 
654 aa  55.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0332  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  33.33 
 
 
313 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.0219127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  28.7 
 
 
667 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  26.71 
 
 
873 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  24.63 
 
 
667 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  25.91 
 
 
880 aa  53.9  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  27.22 
 
 
669 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  23.81 
 
 
898 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  24.18 
 
 
660 aa  51.6  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  25.94 
 
 
654 aa  52  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  22.82 
 
 
332 aa  50.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  27.27 
 
 
672 aa  50.4  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  25.33 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  25.33 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  25.33 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  25.33 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2466  polynucleotide adenylyltransferase region  33.33 
 
 
872 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  25.33 
 
 
657 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  25.33 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  25.33 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  25.46 
 
 
875 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  30.63 
 
 
907 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  25.33 
 
 
657 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0532  Inorganic diphosphatase  32 
 
 
305 aa  49.3  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  29.65 
 
 
909 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1002  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  30.56 
 
 
311 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285783  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  24.76 
 
 
904 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>