More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2405 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  100 
 
 		 321 aa  651    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  73.9 
 
 		 319 aa  477  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  73.11 
 
 		 332 aa  476  1e-133  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  74.61 
 
 		 319 aa  474  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  66.46 
 
 		 326 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  41.46 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  41.14 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  39.75 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  36.02 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  34.47 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  32.92 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  33.87 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  31.87 
 
 		 308 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  31.87 
 
 		 308 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  34.78 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  37.7 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  33.76 
 
 		 309 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  33.03 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  33.03 
 
 		 323 aa  176  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  34.67 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  29.25 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  34.29 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  32.92 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  32.27 
 
 		 328 aa  163  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  32.53 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  32 
 
 		 376 aa  143  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  31.29 
 
 		 363 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  34.29 
 
 		 422 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  33.33 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  28.16 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  27.85 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  30.49 
 
 		 329 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  28.27 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  26.9 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  26.18 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  27.52 
 
 		 330 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  26.58 
 
 		 287 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  29.09 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  27.22 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  28.53 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  24.84 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  28.44 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  27.19 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  28.84 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  24.92 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  26.11 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  29.28 
 
 		 297 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  25.24 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  27.85 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  27.67 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  28.62 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2322  PP-loop domain-containing protein  25.16 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.346098 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  25.68 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  27.16 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  27.33 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0225  PP-loop domain-containing protein  24.73 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  26.48 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0228  C32 tRNA thiolase  29.52 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.608428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0330  C32 tRNA thiolase  27.7 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1320  PP-loop domain-containing protein  24.24 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0175  PP-loop domain-containing protein  22.43 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1238  PP-loop domain protein  25.09 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0068  C32 tRNA thiolase  27.47 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  28.38 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0175  C32 tRNA thiolase  27.04 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0772  C32 tRNA thiolase  28.73 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.26194  normal  0.702409 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0184  C32 tRNA thiolase  27.04 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0309  C32 tRNA thiolase  27.24 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0060  C32 tRNA thiolase  27.47 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.867348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0227  C32 tRNA thiolase  26.61 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0875  PP-loop  28.09 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00139883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  28.89 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  28.89 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1512  C32 tRNA thiolase  27.34 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.8984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1203  C32 tRNA thiolase  27.24 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1062  C32 tRNA thiolase  27.61 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0509  C32 tRNA thiolase  26.39 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252102  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2723  C32 tRNA thiolase  27.61 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0610151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  27.4 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  28.19 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1243  C32 tRNA thiolase  26.85 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000805224 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1391  hypothetical protein  25.74 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.738362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2221  C32 tRNA thiolase  27.6 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0875  C32 tRNA thiolase  28.41 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.266881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2224  C32 tRNA thiolase  26.01 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00242897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4143  C32 tRNA thiolase  25.37 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1195  PP-loop domain-containing protein  25.71 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1841  C32 tRNA thiolase  26.24 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000126519  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0797  PP-loop domain-containing protein  23.81 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0613954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2880  hypothetical protein  25.53 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0778  C32 tRNA thiolase  28.3 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.344606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2871  C32 tRNA thiolase  27.88 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.77837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0695  C32 tRNA thiolase  26.58 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4232  C32 tRNA thiolase  27.34 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1514  PP-loop family protein  26.67 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4076  C32 tRNA thiolase  26.85 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1995  C32 tRNA thiolase  25.5 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0619881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  28.76 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4186  C32 tRNA thiolase  27.8 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2579  PP-loop domain protein  30.45 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0282863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>