More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3675 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3675  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 380 aa  747    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  85.53 
 
 		 378 aa  642    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1105  porphobilinogen deaminase  66.21 
 
 		 377 aa  485  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.101851  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2252  porphobilinogen deaminase  61.7 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.10668  normal  0.034816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0927  porphobilinogen deaminase  60.38 
 
 		 373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0460194  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  39.38 
 
 		 309 aa  232  9e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  37.26 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  37.57 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  33.61 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  37.33 
 
 		 312 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  34.75 
 
 		 311 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  36.31 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  33.89 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  36.59 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  37.65 
 
 		 270 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  35.75 
 
 		 318 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  35.93 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  36.11 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  34.64 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  34.43 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  33.05 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  38.06 
 
 		 317 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  40.99 
 
 		 358 aa  172  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  35.25 
 
 		 313 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  36.07 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  38.16 
 
 		 316 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  35.16 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  35.31 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  34.81 
 
 		 311 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4579  porphobilinogen deaminase  38.8 
 
 		 312 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  37.25 
 
 		 315 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  33.7 
 
 		 311 aa  169  9e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  36.92 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  32.6 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  36.7 
 
 		 295 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  34.45 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  35.75 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  35.33 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  35.09 
 
 		 542 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  32.96 
 
 		 309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  33.33 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  30.96 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  34.86 
 
 		 320 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  32.68 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  35.91 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  33.33 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  34.79 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  34.92 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  34.07 
 
 		 312 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  31.27 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  34.81 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  30.7 
 
 		 307 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  30.7 
 
 		 307 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  36.03 
 
 		 314 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  33.77 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  34.73 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  34.63 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  36.64 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 312 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  30.9 
 
 		 308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  37.05 
 
 		 314 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  37.05 
 
 		 314 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  31.65 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  33.89 
 
 		 294 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  34.45 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  32.33 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  33.88 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  34.44 
 
 		 294 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  33.97 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  32.35 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  33.71 
 
 		 305 aa  160  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  34.15 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  32.96 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  34.37 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  33.33 
 
 		 317 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  32.97 
 
 		 314 aa  160  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  32.5 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1978  porphobilinogen deaminase  37.25 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000417837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  33.06 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  34.16 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  32.14 
 
 		 310 aa  159  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0118  porphobilinogen deaminase  34.27 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  30.11 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  33.98 
 
 		 309 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  35.88 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  33.06 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  31.02 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  31.02 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  32.69 
 
 		 313 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  32.22 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  34.44 
 
 		 303 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  31.39 
 
 		 316 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  31.96 
 
 		 310 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>