More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23240 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  100 
 
 		 415 aa  831    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  49.88 
 
 		 411 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.91 
 
 		 419 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  28.47 
 
 		 419 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 		 830 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  23.02 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  27.96 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  24.69 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  23.54 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  26.98 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  26.25 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  22.95 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  27.22 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  24.64 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.76 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  24.88 
 
 		 406 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  21.9 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  23.71 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  26.05 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  23.24 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  24.34 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  25.21 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  25.64 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  22.64 
 
 		 425 aa  99.8  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  22.14 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  21.69 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  26 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.52 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.37 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.8 
 
 		 416 aa  96.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.12 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1663  protein of unknown function DUF214  23.19 
 
 		 535 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  23.8 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  24.82 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  21.27 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.69 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  26.17 
 
 		 441 aa  94.4  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2783  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.46 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2475  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.41 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  25.48 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.71 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  22.6 
 
 		 422 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.38 
 
 		 415 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  26.2 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.35 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  19.86 
 
 		 411 aa  90.9  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.83 
 
 		 420 aa  90.1  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2826  protein of unknown function DUF214  28.79 
 
 		 406 aa  90.1  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 		 423 aa  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  23.42 
 
 		 428 aa  89.7  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.25 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  25.92 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1781  lipoprotein releasing system  20.28 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0490622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  26.96 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1602  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.44 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0219168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1709  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.44 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.105135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2861  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.44 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.304015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.55 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0692  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.01 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  21.92 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  24.17 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  23.5 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  22.14 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  21.77 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  26.45 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0609  protein of unknown function DUF214  22.74 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000928533  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.71 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1376  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.71 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0730301  normal  0.0697431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.77 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  24.71 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1547  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.14 
 
 		 417 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124688  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2003  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.72 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0260565 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.93 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  22.01 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  19.81 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  21.28 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  28.03 
 
 		 644 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  23.06 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  24.92 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  25.29 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.74 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.14 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  25.29 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  21.17 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.9 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  23.61 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0590  hypothetical protein  21.5 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>