More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5570 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  100 
 
 
334 aa  670    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  45.76 
 
 
281 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  45.02 
 
 
287 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  46.29 
 
 
296 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  41.55 
 
 
303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  41.3 
 
 
310 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  39.08 
 
 
303 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  41.58 
 
 
533 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  38.98 
 
 
351 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  40.07 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  40.78 
 
 
304 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  41.55 
 
 
308 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  40.36 
 
 
304 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  39.42 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  39.3 
 
 
306 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  37.46 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  39.06 
 
 
324 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  39.93 
 
 
312 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  37.54 
 
 
302 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  38.87 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  38.71 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  39.36 
 
 
316 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  39.36 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  39.36 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  39.36 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  39.36 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  42.23 
 
 
307 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  37.04 
 
 
545 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  37.81 
 
 
304 aa  168  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  36.43 
 
 
340 aa  168  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  38.52 
 
 
312 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.77 
 
 
300 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  39.05 
 
 
302 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  38.19 
 
 
322 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  41.43 
 
 
307 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  38.6 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  38.85 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  37.81 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  35.76 
 
 
286 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  36.82 
 
 
318 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  38.03 
 
 
313 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  36.26 
 
 
323 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  35.57 
 
 
304 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  35.88 
 
 
310 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  35.62 
 
 
362 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  37.2 
 
 
357 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  34.43 
 
 
281 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  36.7 
 
 
372 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  35.37 
 
 
352 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  35.53 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  33.68 
 
 
295 aa  153  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  37.24 
 
 
350 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  34.07 
 
 
281 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  37.58 
 
 
339 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  36.64 
 
 
366 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  34.88 
 
 
325 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  34.64 
 
 
332 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  34.88 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  33.24 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  35.58 
 
 
314 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  35.52 
 
 
363 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.07 
 
 
407 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  29.34 
 
 
398 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  32.81 
 
 
371 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.58 
 
 
368 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  31.94 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.22 
 
 
306 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32 
 
 
415 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  30.58 
 
 
338 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.97 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  30.22 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  34.67 
 
 
340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.21 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  32.42 
 
 
327 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.26 
 
 
307 aa  126  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.94 
 
 
406 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  31.9 
 
 
343 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  30 
 
 
338 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  31.89 
 
 
247 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  29.08 
 
 
338 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.47 
 
 
297 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.37 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.37 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.43 
 
 
313 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  35.2 
 
 
183 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.43 
 
 
313 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  35.2 
 
 
183 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.92 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.42 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.42 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  30.04 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.2 
 
 
313 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.92 
 
 
579 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.01 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.64 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.88 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.12 
 
 
305 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  29.59 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  28.32 
 
 
299 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  26.78 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>