213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5078 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5078  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  845    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2940  hypothetical protein  44.21 
 
 		 474 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3026  hypothetical protein  43.6 
 
 		 473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.443921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2216  hypothetical protein  33.55 
 
 		 547 aa  219  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3404  hypothetical protein  29.32 
 
 		 500 aa  183  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.552289  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6837  Cytochrome-c peroxidase  31.52 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2275  cytochrome C peroxidase  24.3 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0523  cytochrome C peroxidase  25.48 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  27.87 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3799  Cytochrome-c peroxidase  32.73 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0226321  normal  0.14874 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4968  di-heme cytochrome c peroxidase  32 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222129  normal  0.30735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3631  cytochrome-c peroxidase  37.5 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0409  cytochrome-c peroxidase  45 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0505  cytochrome-c peroxidase  35.53 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0442639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7510  putative di-haem cytochrome c peroxidase  30.57 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  35.03 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09198  methylamine utilization protein/Cytochrome c peroxidase  30 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0812  Cytochrome-c peroxidase  29.03 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0203  cytochrome-c peroxidase  31.08 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.908377  normal  0.102484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  29.41 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  32.43 
 
 		 768 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0196  Cytochrome-c peroxidase  30.67 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04430  probable cytochrome-c peroxidase  28.32 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2684  cytochrome-c peroxidase  30.67 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.831831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2854  cytochrome-c peroxidase  39.77 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2744  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0810  Cytochrome-c peroxidase  53.06 
 
 		 336 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0285  Cytochrome-c peroxidase  30.87 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906916  normal  0.908563 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0994  Cytochrome-c peroxidase  30.41 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  25.27 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  28.09 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  35.34 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1968  cytochrome-c peroxidase  32.67 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0786511  normal  0.0102191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1935  cytochrome-c peroxidase  42.11 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.28817  normal  0.0197442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1343  di-haem cytochrome c peroxidase  30.13 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4685  Cytochrome-c peroxidase  24.82 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0145  di-haem cytochrome c peroxidase  29.27 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2943  cytochrome c551 peroxidase, putative  30.47 
 
 		 332 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.258388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0552  cytochrome-c peroxidase  24.72 
 
 		 333 aa  57  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0345  cytochrome c peroxidase family protein  46.48 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  35.87 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0098  Cytochrome-c peroxidase  33.03 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  28.94 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  29.29 
 
 		 390 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3699  Cytochrome-c peroxidase  30.82 
 
 		 328 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0900  Cytochrome-c peroxidase  27.4 
 
 		 337 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.897307 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0448  cytochrome-c peroxidase  29.73 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4821  cytochrome-c peroxidase  31.25 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4460  Cytochrome-c peroxidase  26.51 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0825354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2772  cytochrome-c peroxidase  31.93 
 
 		 352 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0101  Cytochrome-c peroxidase  33.33 
 
 		 348 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1193  cytochrome-c peroxidase  33.83 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1205  cytochrome-c peroxidase  29.33 
 
 		 331 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2425  di-haem cytochrome c peroxidase  28 
 
 		 333 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4161  Cytochrome-c peroxidase  40 
 
 		 598 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171649  normal  0.0843454 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4851  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3342  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 427 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2999  Cytochrome-c peroxidase  31.93 
 
 		 352 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0979676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3411  cytochrome-c peroxidase  28.48 
 
 		 459 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3278  cytochrome c peroxidase  28.48 
 
 		 459 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0940  cytochrome c peroxidase  28.48 
 
 		 459 aa  53.5  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0216007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4553  di-haem cytochrome c peroxidase  30.58 
 
 		 314 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2216  cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 333 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.833692  normal  0.516209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2292  cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 333 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.273294  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0811  cytochrome-c peroxidase  30 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2178  cytochrome c551 peroxidase  28.67 
 
 		 333 aa  53.1  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0005  di-haem cytochrome c peroxidase  28.25 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2573  cytochrome-c peroxidase  28.93 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1590  cytochrome-c peroxidase  32.67 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.133335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  26.24 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3522  Cytochrome-c peroxidase  43.48 
 
 		 333 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044968  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2426  cytochrome c551 peroxidase  29.3 
 
 		 333 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0020  Di-haem cytochrome c peroxidase  34.88 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  31.97 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3124  cytochrome-c peroxidase  27.42 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3135  cytochrome-c peroxidase  30.82 
 
 		 302 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5043  Di-heme cytochrome c peroxidase  29.94 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.772632  normal  0.822477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  36.64 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3904  cytochrome-c peroxidase  27.56 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  25.75 
 
 		 369 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3264  putative lipoprotein  28.47 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0900438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1818  Cytochrome-c peroxidase  27.7 
 
 		 344 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.680331  normal  0.132089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1754  Cytochrome-c peroxidase  26.21 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0761151  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  32.82 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2648  cytochrome-c peroxidase  27.7 
 
 		 344 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0545437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0047  cytochrome c551 peroxidase  28.38 
 
 		 304 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2533  cytochrome-c peroxidase  27.7 
 
 		 344 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2287  cytochrome-c peroxidase  28 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00278861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2526  cytochrome-c peroxidase  27.7 
 
 		 344 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  40.58 
 
 		 351 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2477  cytochrome-c peroxidase  28.39 
 
 		 594 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233589  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2378  cytochrome-c peroxidase  29.05 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4152  cytoChrome-c peroxidase  30.67 
 
 		 466 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4210  cytochrome-c peroxidase  30.67 
 
 		 466 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4031  cytoChrome-c peroxidase  30.67 
 
 		 466 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5504  Di-heme cytochrome c peroxidase  31.67 
 
 		 297 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4328  Cytochrome-c peroxidase  28.78 
 
 		 398 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1673  hypothetical protein  39.44 
 
 		 681 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.617878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2892  cytochrome-c peroxidase  27.39 
 
 		 399 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4048  cytoChrome-c peroxidase  30.67 
 
 		 466 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>