More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1250 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  57.29 
 
 		 1271 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  58.22 
 
 		 612 aa  656    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  56.07 
 
 		 618 aa  660    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  56.28 
 
 		 1271 aa  636    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 644 aa  1316    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.74 
 
 		 615 aa  625  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  52.64 
 
 		 678 aa  600  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.43 
 
 		 619 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.67 
 
 		 900 aa  497  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  44.06 
 
 		 1072 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  43.25 
 
 		 599 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  44.06 
 
 		 856 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  43.13 
 
 		 880 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  45.74 
 
 		 826 aa  474  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  43.88 
 
 		 608 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  44.85 
 
 		 850 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  44.54 
 
 		 844 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  44.83 
 
 		 866 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  43.27 
 
 		 850 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  43.22 
 
 		 826 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  43.85 
 
 		 862 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  42.07 
 
 		 866 aa  458  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  44.02 
 
 		 900 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  42.6 
 
 		 862 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.15 
 
 		 886 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.17 
 
 		 886 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  44.32 
 
 		 886 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  44.15 
 
 		 886 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.22 
 
 		 877 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  43.09 
 
 		 811 aa  438  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  43.33 
 
 		 826 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.77 
 
 		 736 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.38 
 
 		 639 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  41.07 
 
 		 605 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  37.3 
 
 		 739 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  39.15 
 
 		 859 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  34.49 
 
 		 758 aa  346  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.45 
 
 		 762 aa  330  7e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  33.02 
 
 		 755 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  33.75 
 
 		 750 aa  312  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  35.37 
 
 		 737 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  32.06 
 
 		 820 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  31.5 
 
 		 759 aa  306  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.11 
 
 		 702 aa  296  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  33.08 
 
 		 790 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.28 
 
 		 749 aa  287  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.33 
 
 		 828 aa  286  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  31.72 
 
 		 743 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  31.42 
 
 		 740 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  34.55 
 
 		 738 aa  276  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  33.44 
 
 		 750 aa  272  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.8 
 
 		 754 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.39 
 
 		 765 aa  271  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.69 
 
 		 765 aa  270  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  31.19 
 
 		 787 aa  269  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.63 
 
 		 778 aa  269  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  32.98 
 
 		 772 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 		 805 aa  266  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  33.6 
 
 		 721 aa  266  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.6 
 
 		 795 aa  266  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.61 
 
 		 723 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  30.58 
 
 		 778 aa  265  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  31.01 
 
 		 777 aa  259  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.63 
 
 		 751 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  30.38 
 
 		 743 aa  257  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  31.08 
 
 		 745 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  31.6 
 
 		 727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  30.95 
 
 		 727 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  33.18 
 
 		 764 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.13 
 
 		 807 aa  252  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  30.32 
 
 		 772 aa  248  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  30.52 
 
 		 766 aa  248  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.74 
 
 		 804 aa  246  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  31.1 
 
 		 755 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  31.1 
 
 		 755 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  31.1 
 
 		 755 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  31.1 
 
 		 765 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.16 
 
 		 762 aa  244  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  31.51 
 
 		 751 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  30.95 
 
 		 755 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  30.29 
 
 		 765 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.83 
 
 		 771 aa  243  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.8 
 
 		 714 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.6 
 
 		 733 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.08 
 
 		 757 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.18 
 
 		 780 aa  240  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.28 
 
 		 752 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  31.87 
 
 		 759 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.49 
 
 		 774 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.23 
 
 		 751 aa  237  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  31.11 
 
 		 772 aa  237  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 		 753 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.81 
 
 		 756 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.27 
 
 		 783 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.76 
 
 		 860 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.46 
 
 		 766 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.61 
 
 		 742 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  29.95 
 
 		 765 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.95 
 
 		 765 aa  233  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  29.95 
 
 		 765 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>