More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0630 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0630  DNA primase catalytic core domain protein  100 
 
 		 1026 aa  2100    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0772  DNA primase catalytic core domain protein  98.83 
 
 		 1026 aa  2076    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1025  hypothetical protein  45.47 
 
 		 945 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0592  hypothetical protein  43.85 
 
 		 945 aa  475  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0907  Zn-finger, CHC2 type  33.62 
 
 		 1098 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3790  DNA primase catalytic core  38.99 
 
 		 1103 aa  170  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1921  DNA primase-like  38.63 
 
 		 1103 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501943  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  25.74 
 
 		 851 aa  149  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  25.18 
 
 		 590 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  29.01 
 
 		 655 aa  130  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  24.94 
 
 		 590 aa  127  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  24.65 
 
 		 588 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 604 aa  121  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1888  hypothetical protein  25.55 
 
 		 527 aa  119  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  29.19 
 
 		 629 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  29.19 
 
 		 629 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  26.49 
 
 		 583 aa  114  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  26.46 
 
 		 598 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  25.83 
 
 		 599 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  27.12 
 
 		 574 aa  111  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  29.29 
 
 		 647 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  27.13 
 
 		 593 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  27.13 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  27.01 
 
 		 633 aa  110  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  27.83 
 
 		 639 aa  109  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  27.44 
 
 		 641 aa  109  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  25.48 
 
 		 621 aa  108  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  27.29 
 
 		 574 aa  108  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  28.76 
 
 		 627 aa  108  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  27.51 
 
 		 611 aa  108  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  26.07 
 
 		 574 aa  108  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  27.21 
 
 		 641 aa  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  26.07 
 
 		 574 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  27.38 
 
 		 655 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  27.78 
 
 		 660 aa  106  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  26.95 
 
 		 601 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  26.07 
 
 		 574 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  28.68 
 
 		 452 aa  106  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  26.12 
 
 		 651 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  25.95 
 
 		 600 aa  105  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  27.61 
 
 		 613 aa  105  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  25.8 
 
 		 574 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  25.8 
 
 		 574 aa  105  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  25.64 
 
 		 574 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  25.38 
 
 		 584 aa  104  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  25.67 
 
 		 652 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  26.06 
 
 		 655 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  29.84 
 
 		 619 aa  104  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  26.89 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  26.3 
 
 		 564 aa  104  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1626  DNA primase  25.43 
 
 		 647 aa  103  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00201523 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  24.56 
 
 		 544 aa  103  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  23.76 
 
 		 539 aa  103  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  26.65 
 
 		 575 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  25.27 
 
 		 601 aa  102  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  26.68 
 
 		 595 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  26.17 
 
 		 664 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  25.95 
 
 		 576 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  25.94 
 
 		 663 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1480  DNA primase  26.24 
 
 		 669 aa  102  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  26.79 
 
 		 638 aa  102  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  23.76 
 
 		 581 aa  101  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  23.76 
 
 		 581 aa  101  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  26.09 
 
 		 618 aa  101  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  27.02 
 
 		 605 aa  101  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  26.44 
 
 		 663 aa  101  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  26.36 
 
 		 595 aa  101  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  23.76 
 
 		 581 aa  101  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  23.76 
 
 		 581 aa  101  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  23.76 
 
 		 581 aa  101  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2441  DNA primase  24.61 
 
 		 634 aa  101  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0792467  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  23.76 
 
 		 581 aa  101  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  23.76 
 
 		 581 aa  101  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  23.76 
 
 		 581 aa  101  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4132  DNA primase  26.45 
 
 		 683 aa  101  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  26.35 
 
 		 574 aa  100  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  24.89 
 
 		 626 aa  100  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  24.27 
 
 		 582 aa  100  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  25.78 
 
 		 576 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  27.08 
 
 		 613 aa  100  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  24.29 
 
 		 595 aa  100  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  28.42 
 
 		 656 aa  99.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3973  DNA primase  26.45 
 
 		 685 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  25.83 
 
 		 645 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  23.76 
 
 		 581 aa  99.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  24 
 
 		 591 aa  100  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2867  DNA primase  23.56 
 
 		 633 aa  99.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00143827  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  26.34 
 
 		 614 aa  99.8  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  27.25 
 
 		 601 aa  99  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  23.65 
 
 		 565 aa  99  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  26.94 
 
 		 578 aa  98.6  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  28.79 
 
 		 647 aa  99  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  25.12 
 
 		 639 aa  98.6  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  30.8 
 
 		 623 aa  98.2  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  26.71 
 
 		 594 aa  97.8  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  23.08 
 
 		 584 aa  97.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  23.47 
 
 		 576 aa  97.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  28.04 
 
 		 587 aa  97.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0970  DNA primase  27.32 
 
 		 680 aa  97.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0143224 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  24.23 
 
 		 606 aa  97.1  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>