More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1266 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1266  aminotransferase class IV  100 
 
 		 285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  50.71 
 
 		 285 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0290  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.76 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0106  D-amino acid aminotransferase, putative  43.73 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1969  D-amino-acid transaminase  46.64 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  44.33 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2631  D-alanine transaminase  43.48 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  41.16 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0267  D-alanine transminase  44.64 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1013  D-amino-acid transaminase  44.44 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1990  aminotransferase, class IV  39.93 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1309  D-alanine aminotransferase  38.79 
 
 		 282 aa  211  9e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00550682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4238  aminotransferase class IV  38.23 
 
 		 303 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1840  D-alanine aminotransferase  35.61 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1805  D-alanine aminotransferase  35.61 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1516  hypothetical protein  36.43 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2498  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.5 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1467  hypothetical protein  35.71 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  38.25 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1037  aminotransferase, class IV  37.98 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2609  D-amino acid aminotransferase  40.65 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0997  aminotransferase class IV  38.03 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0312  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.25 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.381931  hitchhiker  0.00369905 
 
 
-
 
NC_003296  RS01735  putative D-alanine aminotransferase (D-aspartate aminotransferase) protein  39.71 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01083  D-alanine transaminase  37.63 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.086093  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5636  aminotransferase class IV  38.21 
 
 		 285 aa  192  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.931733  normal  0.467738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0938  aminotransferase class IV  37.19 
 
 		 285 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1546  aminotransferase, class IV  37.98 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4024  aminotransferase, class IV  36.36 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0317  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.21 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.560202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2249  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  37.18 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1015  aminotransferase class IV  40 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4521  aminotransferase class IV  39.35 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.419436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4653  aminotransferase class IV  39.35 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520595 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1852  D-alanine aminotransferase  34.89 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.961787  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2552  aminotransferase, class IV  39.86 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0536  aminotransferase class IV  37.91 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0904931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  40.22 
 
 		 286 aa  185  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2225  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.99 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1524  aminotransferase class IV  39.64 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  0.424589 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4609  aminotransferase class IV  36.84 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.296003  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0563  D-alanine aminotransferase  34.29 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2788  aminotransferase class IV  37.68 
 
 		 286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4878  aminotransferase class IV  36.46 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7579  aminotransferase class IV  40.07 
 
 		 282 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241195  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0630  aminotransferase class IV  38.1 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1094  D-amino acid aminotransferase  38.65 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4394  aminotransferase class IV  38.93 
 
 		 285 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.124459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5914  D-amino acid aminotransferase  37.06 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0246  aminotransferase, class IV  36.59 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1447  D-amino acid aminotransferase  37.99 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.614187  hitchhiker  0.000494555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2804  aminotransferase class IV  38.69 
 
 		 308 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1465  D-amino-acid transaminase  36.88 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0439  putative D-amino acid aminotransferase  38.91 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0381  D-amino acid aminotransferase  39.27 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1210  aminotransferase class IV  35.92 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0459  putative D-amino acid aminotransferase  38.91 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0057  D-amino acid aminotransferase  38.91 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0621  D-amino acid aminotransferase  38.91 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3191  D-amino acid aminotransferase  38.91 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0223  D-amino acid aminotransferase  38.91 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1370  D-amino acid aminotransferase  38.91 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3767  D-amino acid aminotransferase  37.41 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140318  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6235  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.32 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.513933 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3168  aminotransferase, class IV  35.51 
 
 		 286 aa  175  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1171  D-amino acid aminotransferase  32.63 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.762011  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2484  aminotransferase, class IV  35.51 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1768  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.59 
 
 		 286 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1631  D-amino acid aminotransferase  37.94 
 
 		 287 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0412  aminotransferase class IV  38.32 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11828  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5026  D-amino acid aminotransferase  37.88 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00344557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3150  D-alanine aminotransferase  36.86 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0153378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0414  aminotransferase, class IV  36.23 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0499  aminotransferase class IV  36.73 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2942  aminotransferase, class IV  38.69 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  34.41 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2902  aminotransferase class IV  38.91 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4217  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  36.86 
 
 		 321 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.754145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2366  D-amino acid aminotransferase  33.69 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00514849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2079  D-amino acid aminotransferase  33.81 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.281204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5604  D-amino acid aminotransferase  35.19 
 
 		 306 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000400845  unclonable  1.75706e-25 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2277  aminotransferase, class IV  38.55 
 
 		 308 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2892  aminotransferase, class IV  38.55 
 
 		 308 aa  171  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5356  D-amino acid aminotransferase  35.56 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1818  D-amino acid aminotransferase  37.72 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514691  normal  0.0349622 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3125  aminotransferase class IV  36.65 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427478 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0798  aminotransferase, class IV  34.39 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0363  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.04 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2593  D-amino acid aminotransferase  37.41 
 
 		 285 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0296387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2238  D-amino acid aminotransferase  33.81 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5405  D-amino acid aminotransferase  35.71 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000087817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1294  D-amino-acid transaminase  34.3 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  34.62 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>