More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0999 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0999  histidine kinase  100 
 
 		 326 aa  634    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.88 
 
 		 572 aa  212  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578551  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 		 1045 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 		 590 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1519  histidine kinase  47.62 
 
 		 541 aa  192  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.781722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3658  histidine kinase  42.86 
 
 		 483 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 		 657 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.514383  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2889  histidine kinase  47.66 
 
 		 549 aa  185  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 632 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1749  histidine kinase  46.12 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 873 aa  182  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 529 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0469  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.235953  normal  0.329223 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  42.74 
 
 		 573 aa  178  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2813  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 590 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1870  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.67 
 
 		 758 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  42.31 
 
 		 573 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 921 aa  176  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0313  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 		 580 aa  176  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 570 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 1300 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 477 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.08 
 
 		 655 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.71 
 
 		 691 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1231  histidine kinase  45.85 
 
 		 376 aa  165  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000541094 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2066  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 546 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0718  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 649 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.746522 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1646  histidine kinase  42.18 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3216  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 		 568 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0600543  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3488  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.66 
 
 		 468 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 830 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 475 aa  152  7e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.84 
 
 		 875 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 516 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.989107 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1771  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 669 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1263  histidine kinase  40.2 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 700 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1026  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 599 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0934785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 759 aa  143  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  37.05 
 
 		 511 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1809  histidine kinase  36.98 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2509  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 627 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 659 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3337  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 685 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 896 aa  133  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2126  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 559 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.386093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 619 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00154856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 671 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  39.19 
 
 		 945 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1519  histidine kinase  37.12 
 
 		 505 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0112832 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 669 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1570  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.834028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1974  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 		 642 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1591  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.93 
 
 		 666 aa  102  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0028  putative phytochrome sensor protein  33.18 
 
 		 713 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  36.04 
 
 		 464 aa  92.8  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  31.51 
 
 		 611 aa  92.4  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 463 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.24 
 
 		 1162 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 469 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 502 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  33.78 
 
 		 464 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  35.07 
 
 		 464 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  35.07 
 
 		 715 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  35.07 
 
 		 464 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  35.07 
 
 		 464 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  35.07 
 
 		 464 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  35.07 
 
 		 464 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  34.95 
 
 		 347 aa  89.4  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1810  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 488 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.081179 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 713 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11101  two-component sensor histidine kinase, phosphate sensing  29.26 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.330721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 579 aa  87.4  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.25 
 
 		 466 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0747  histidine kinase  36.76 
 
 		 471 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  33.62 
 
 		 476 aa  86.3  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 409 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 712 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0547872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 601 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 734 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 504 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  32.09 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 601 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  33.18 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2144  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  34.07 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.31 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>