More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2048 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 348 aa  688    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2538  Dimethylallyltranstransferase  69.91 
 
 		 349 aa  471  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0443  Dimethylallyltranstransferase  68.3 
 
 		 349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.843643  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2608  Polyprenyl synthetase  64.29 
 
 		 344 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  0.754762 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2049  Polyprenyl synthetase  61.21 
 
 		 346 aa  394  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000493992  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  49.26 
 
 		 322 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  49.56 
 
 		 321 aa  309  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  47.98 
 
 		 327 aa  296  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  49.2 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  44.55 
 
 		 325 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  46.15 
 
 		 320 aa  258  8e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  43.27 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  42.81 
 
 		 322 aa  236  6e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  35.74 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  37.76 
 
 		 317 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  43.03 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  37.17 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 317 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  37.66 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  36.23 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  33.15 
 
 		 332 aa  179  9e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  33.43 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  32.46 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  32.73 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  31.36 
 
 		 326 aa  172  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.13 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  35.01 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.1 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1235  Polyprenyl synthetase  35.65 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  40.51 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  32.56 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  33.63 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.74 
 
 		 364 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  31.6 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 321 aa  166  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  36.51 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  37.01 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  35.16 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  36.04 
 
 		 349 aa  163  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.19 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 322 aa  162  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 331 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  34.84 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.45 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  35.42 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  35.5 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.45 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  34.12 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  34.12 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  34.12 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  34.12 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  33.64 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  34.12 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  33.64 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  34.12 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  33.64 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  34.24 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  33.64 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  33.64 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  34.12 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  34.12 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  34.12 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  34.28 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  34.28 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.27 
 
 		 354 aa  159  6e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 322 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  33.23 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  32.96 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  34.41 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  32.96 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  32.46 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  35.05 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 322 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  30.41 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  34.47 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  33.33 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  34.47 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  34.47 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  38.18 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  33.01 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  34.2 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  33.66 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  33.22 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  30.09 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.29 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  34.5 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  34.5 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  31.58 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>