207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0614 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0614  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
518 aa  1003    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.101313  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2417  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  60.96 
 
 
523 aa  588  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  33.54 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  32.45 
 
 
473 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  30.54 
 
 
468 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  31.09 
 
 
466 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  27.84 
 
 
483 aa  159  8e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  27.84 
 
 
483 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  27.64 
 
 
470 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 
455 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  24.6 
 
 
437 aa  77  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  23.44 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  25.12 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  23.02 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  23.94 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  22.67 
 
 
445 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  22.67 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  22.89 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  22.22 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  26.2 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  22.68 
 
 
445 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  23.23 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  22.93 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  33.33 
 
 
552 aa  68.2  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  23.23 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  23.23 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  23.23 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  23.23 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  23.52 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  25 
 
 
441 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  22.37 
 
 
438 aa  67  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  24.65 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  24.01 
 
 
443 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  22 
 
 
445 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  20.41 
 
 
457 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  23.49 
 
 
447 aa  65.1  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  22.73 
 
 
444 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  22.73 
 
 
444 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  22.73 
 
 
444 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  31.52 
 
 
515 aa  63.9  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  25.55 
 
 
440 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  20.75 
 
 
442 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  31.72 
 
 
520 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  22.55 
 
 
438 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  32.14 
 
 
524 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  24.7 
 
 
458 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  23.33 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  21.23 
 
 
443 aa  62.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  22.55 
 
 
438 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  31.55 
 
 
518 aa  62  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  33.02 
 
 
461 aa  61.6  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  32.73 
 
 
431 aa  61.6  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  22.55 
 
 
438 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  27.54 
 
 
587 aa  61.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  21.97 
 
 
472 aa  61.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  23.59 
 
 
494 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  36.27 
 
 
458 aa  60.8  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  33.13 
 
 
457 aa  60.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  22.19 
 
 
444 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  31.87 
 
 
526 aa  60.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0461  Na+/H+ antiporter NhaC  27.27 
 
 
483 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  24.42 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  25.17 
 
 
449 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  30.69 
 
 
522 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  30.19 
 
 
533 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  24.11 
 
 
454 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  32.86 
 
 
522 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  32.86 
 
 
522 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  22.49 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  22.49 
 
 
493 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  28.18 
 
 
466 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  28.79 
 
 
521 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  35 
 
 
529 aa  58.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  29.19 
 
 
533 aa  58.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  30 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  32.86 
 
 
522 aa  58.2  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  30.84 
 
 
517 aa  57.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  30.16 
 
 
522 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  30.16 
 
 
522 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  30.16 
 
 
522 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  27.57 
 
 
533 aa  57.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  30.16 
 
 
522 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  24.06 
 
 
431 aa  56.6  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  24.28 
 
 
437 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  25.42 
 
 
437 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  26.58 
 
 
515 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  32.86 
 
 
525 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  30.71 
 
 
534 aa  56.6  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  28.7 
 
 
494 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  31.69 
 
 
521 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  30.14 
 
 
463 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  29.58 
 
 
524 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  32.86 
 
 
533 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  32.86 
 
 
525 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  28.57 
 
 
779 aa  55.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  29.89 
 
 
527 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  30.19 
 
 
201 aa  54.3  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  32.63 
 
 
493 aa  54.7  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  29.19 
 
 
528 aa  54.3  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  26.05 
 
 
496 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>