244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01828 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  96.62 
 
 		 533 aa  1014    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  78.48 
 
 		 528 aa  822    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 533 aa  1066    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  69.47 
 
 		 521 aa  727    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  77.86 
 
 		 533 aa  854    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  57.89 
 
 		 526 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  57.78 
 
 		 524 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  57.01 
 
 		 524 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  54.48 
 
 		 522 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  54.48 
 
 		 522 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  55.26 
 
 		 518 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  53.99 
 
 		 522 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  55.68 
 
 		 521 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  57.31 
 
 		 521 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  55.64 
 
 		 522 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  54.75 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  54.47 
 
 		 520 aa  534  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  54.83 
 
 		 522 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  54.83 
 
 		 522 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  54.83 
 
 		 522 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  54.44 
 
 		 522 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  51.64 
 
 		 529 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  50.38 
 
 		 526 aa  505  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  49.71 
 
 		 527 aa  498  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  43.27 
 
 		 520 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  43.59 
 
 		 525 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  43.61 
 
 		 525 aa  364  3e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  42.31 
 
 		 533 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  43.44 
 
 		 546 aa  352  7e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  41.86 
 
 		 574 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  41.74 
 
 		 534 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  37.95 
 
 		 528 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  38.97 
 
 		 525 aa  306  4.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  37.88 
 
 		 567 aa  299  7e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  39.92 
 
 		 532 aa  293  7e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  39.18 
 
 		 517 aa  291  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.35 
 
 		 550 aa  286  5.999999999999999e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.45 
 
 		 557 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  35.62 
 
 		 493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  37.85 
 
 		 552 aa  283  7.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  33.99 
 
 		 497 aa  282  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  34.41 
 
 		 507 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  34.48 
 
 		 515 aa  279  7e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  35.66 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  36.27 
 
 		 497 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  35.22 
 
 		 501 aa  276  8e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  36.27 
 
 		 497 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  34.8 
 
 		 501 aa  273  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  35.01 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  36.05 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  35.84 
 
 		 497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  34.21 
 
 		 570 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  34.42 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  35.01 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  36.4 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  36.2 
 
 		 571 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  37.4 
 
 		 569 aa  266  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  33.65 
 
 		 577 aa  263  6e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  35.23 
 
 		 521 aa  263  6e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  33.65 
 
 		 577 aa  263  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.47 
 
 		 567 aa  262  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  33.27 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  33.96 
 
 		 508 aa  251  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  31.63 
 
 		 513 aa  250  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  36.33 
 
 		 629 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  32.82 
 
 		 507 aa  243  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  36.03 
 
 		 541 aa  240  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.95 
 
 		 564 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  34.45 
 
 		 561 aa  238  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  35.56 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  31.87 
 
 		 587 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.71 
 
 		 556 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  32.51 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  33.8 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  31.66 
 
 		 460 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  31.66 
 
 		 460 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  31.66 
 
 		 460 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  31.66 
 
 		 460 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  31.66 
 
 		 460 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  31.71 
 
 		 460 aa  224  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.14 
 
 		 560 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  31.85 
 
 		 460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  33.72 
 
 		 393 aa  220  6e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  33 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  32.2 
 
 		 460 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  32.21 
 
 		 460 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  30.75 
 
 		 460 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  30.75 
 
 		 460 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.67 
 
 		 638 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  30.75 
 
 		 460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  30.99 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.16 
 
 		 594 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  30.93 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  29.26 
 
 		 493 aa  196  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  31.15 
 
 		 448 aa  193  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  28.07 
 
 		 779 aa  193  6e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  32.05 
 
 		 454 aa  190  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  29.06 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  29.65 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  29.67 
 
 		 574 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>