260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16480 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  83.41 
 
 		 444 aa  725    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 443 aa  867    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  46.37 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  42.6 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  41.5 
 
 		 438 aa  319  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  42.44 
 
 		 441 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  41.27 
 
 		 438 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  40.59 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  40.59 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  40.59 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  40.59 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  40.59 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  40.14 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  40.33 
 
 		 494 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  42.6 
 
 		 438 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  41.59 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  40.82 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  40.82 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  41.65 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  41.65 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  38.46 
 
 		 459 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  38.46 
 
 		 459 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  37.36 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  40.37 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  40.1 
 
 		 437 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  38.33 
 
 		 441 aa  259  7e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  38.5 
 
 		 423 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  36.94 
 
 		 441 aa  253  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  39.73 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  37.59 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  37 
 
 		 461 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  36.5 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  34.94 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  36.91 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  34.43 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  36 
 
 		 445 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  36 
 
 		 445 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  36.25 
 
 		 445 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  34.84 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  37.23 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  35.42 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  36.5 
 
 		 444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  36.5 
 
 		 444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  36.5 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  34.52 
 
 		 455 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  36.36 
 
 		 447 aa  226  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  34.25 
 
 		 454 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  36.5 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  34.12 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  32.86 
 
 		 457 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  34.09 
 
 		 455 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  34.38 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  34.69 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  34.34 
 
 		 449 aa  216  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  35.14 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  34.66 
 
 		 431 aa  209  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  32.04 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  27.16 
 
 		 462 aa  153  5e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  24.34 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  34.18 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  29.75 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  35.22 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  30.73 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  31.53 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  30.73 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  30.73 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  34.55 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  30.73 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1725  Na+/H+ antiporter NhaC  23.57 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  31.11 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  31.11 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  31.11 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  30.58 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  33.74 
 
 		 521 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  31.32 
 
 		 518 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  33.88 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  33.13 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  31.49 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.28 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  31.28 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  31.68 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  23.09 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  30.07 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  23.09 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.67 
 
 		 557 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  22.71 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  24.85 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  22.41 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  26.91 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  34.31 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  27.63 
 
 		 569 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  33.58 
 
 		 534 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  32.11 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  30.57 
 
 		 513 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  30.37 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  31.02 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.89 
 
 		 564 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  32.48 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  21.81 
 
 		 469 aa  63.5  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  30 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>