258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3604 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  100 
 
 		 466 aa  927    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  35.1 
 
 		 507 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  33.91 
 
 		 451 aa  239  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  33.27 
 
 		 510 aa  233  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  33.8 
 
 		 525 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  34.21 
 
 		 533 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  34.55 
 
 		 525 aa  230  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  32.84 
 
 		 393 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  32.67 
 
 		 518 aa  209  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  31.05 
 
 		 522 aa  209  9e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  29.41 
 
 		 476 aa  208  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  31.45 
 
 		 522 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  31.16 
 
 		 522 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  28.98 
 
 		 493 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  31.02 
 
 		 524 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  31.3 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  31.4 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  31.84 
 
 		 526 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  30.69 
 
 		 522 aa  199  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  30.82 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  30.99 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  30.66 
 
 		 571 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.46 
 
 		 571 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  30.77 
 
 		 504 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  31.34 
 
 		 517 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  29.31 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.82 
 
 		 567 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  28.98 
 
 		 515 aa  190  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  29.08 
 
 		 574 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  30.75 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  30.75 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  30.75 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  32.53 
 
 		 534 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  28.23 
 
 		 528 aa  186  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  28.38 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  30.61 
 
 		 527 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  30.55 
 
 		 522 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  29.55 
 
 		 526 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.49 
 
 		 556 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.74 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  30.47 
 
 		 520 aa  180  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  29.92 
 
 		 569 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.34 
 
 		 550 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  31.49 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  27.98 
 
 		 570 aa  177  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  29.16 
 
 		 587 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  28.93 
 
 		 577 aa  176  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  28.99 
 
 		 529 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  28.93 
 
 		 577 aa  176  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  28.54 
 
 		 577 aa  176  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.26 
 
 		 557 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  29.98 
 
 		 513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  28.4 
 
 		 533 aa  173  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  29.06 
 
 		 533 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  28.95 
 
 		 533 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.82 
 
 		 567 aa  169  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  26.58 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.03 
 
 		 564 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  27.63 
 
 		 525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  27.02 
 
 		 541 aa  163  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  27.44 
 
 		 528 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  28.45 
 
 		 629 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  30.11 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  27.77 
 
 		 532 aa  160  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  27.59 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  27.77 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  28.38 
 
 		 552 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  27.82 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  25.34 
 
 		 779 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  27.44 
 
 		 460 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  27.77 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  27.12 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  27.12 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  27.12 
 
 		 460 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  27.12 
 
 		 460 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  27.12 
 
 		 460 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  27.37 
 
 		 460 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  25.22 
 
 		 497 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  27.44 
 
 		 460 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  27.5 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  27.9 
 
 		 546 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  26.65 
 
 		 460 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  26.65 
 
 		 460 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  26.65 
 
 		 460 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25.89 
 
 		 594 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  26.78 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  24.84 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  25.27 
 
 		 507 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  22.72 
 
 		 501 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  25.05 
 
 		 497 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  25.27 
 
 		 493 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  24.42 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  24.56 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.51 
 
 		 638 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  24.4 
 
 		 501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  44.23 
 
 		 201 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  24.07 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  22.88 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  24.03 
 
 		 509 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>