275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1087 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  94.48 
 
 		 444 aa  800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 		 445 aa  876    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  80.18 
 
 		 449 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  92.36 
 
 		 445 aa  814    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  97.08 
 
 		 445 aa  856    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  85.3 
 
 		 457 aa  728    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  84.62 
 
 		 472 aa  728    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  97.3 
 
 		 445 aa  858    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  84.81 
 
 		 447 aa  716    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  97.3 
 
 		 445 aa  857    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  81.12 
 
 		 445 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  94.25 
 
 		 444 aa  798    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  94.25 
 
 		 444 aa  797    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  94.25 
 
 		 444 aa  795    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  84.58 
 
 		 454 aa  734    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  86.97 
 
 		 443 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  58.6 
 
 		 455 aa  494  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  59.32 
 
 		 447 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  58.85 
 
 		 455 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  55.53 
 
 		 443 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  52.95 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  55.48 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  55.66 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  52.1 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  52.07 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  45.84 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  46.21 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  45.23 
 
 		 434 aa  364  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  46.67 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  44.31 
 
 		 438 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  43.43 
 
 		 438 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  43.6 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  43.13 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  43.13 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  43.13 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  43.13 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  43.13 
 
 		 438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  43.51 
 
 		 461 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  43.2 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  41.92 
 
 		 441 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  42.89 
 
 		 493 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  42.89 
 
 		 438 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  39.3 
 
 		 431 aa  331  1e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  43.52 
 
 		 458 aa  326  5e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  42.65 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  40.45 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  41.14 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  41.14 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  40.19 
 
 		 459 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  40.19 
 
 		 459 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  40.81 
 
 		 425 aa  286  5.999999999999999e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  38.02 
 
 		 447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  39.65 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  42.33 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  41.73 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  33.09 
 
 		 462 aa  253  6e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  35.09 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  36.25 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  27.61 
 
 		 468 aa  96.7  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  26.2 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  26.76 
 
 		 473 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  23.65 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  25 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  24.37 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  23.96 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  24.37 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  24.74 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  24.74 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  24.6 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  24.57 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  27.3 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  24.32 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  25.52 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  24.18 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  25.52 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  23.94 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  25.07 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  23.96 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  22.89 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  24.07 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  25.26 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  25.26 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4345  Na+/H+ antiporter NhaC  25.26 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  22.34 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  24.11 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  25 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  22.61 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  24.59 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  34.94 
 
 		 517 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  24.1 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  32.92 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  21.85 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  24.4 
 
 		 473 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  24.35 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0177  Na+/H+ antiporter NhaC  25.98 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>