273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01870 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 458 aa  909    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  51.6 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  49.11 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  49.45 
 
 		 438 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  47.55 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  48.09 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  47.87 
 
 		 438 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  48.09 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  48.09 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  48.09 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  47.64 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  47.64 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  47.19 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  44.91 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  47.64 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  47.64 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  46.7 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  43.94 
 
 		 457 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  43.75 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  43.75 
 
 		 445 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  43.81 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  43.75 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  43.52 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  44.26 
 
 		 443 aa  349  8e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  44.22 
 
 		 454 aa  346  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  43.84 
 
 		 445 aa  346  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  44.7 
 
 		 472 aa  345  7e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  42.34 
 
 		 444 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  42.34 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  44.31 
 
 		 441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  42.34 
 
 		 444 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  43.55 
 
 		 441 aa  339  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  42.34 
 
 		 444 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  44.5 
 
 		 455 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  43.49 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  42.76 
 
 		 447 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  44.65 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  45.18 
 
 		 468 aa  329  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  45.87 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  43.96 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  39.67 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  44.28 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  44.15 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  45.29 
 
 		 447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  41.26 
 
 		 443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  43.86 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  43.86 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  38.65 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  40.67 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  38.96 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  39.62 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  40.09 
 
 		 459 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  40.09 
 
 		 459 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  37.36 
 
 		 443 aa  289  8e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  41.04 
 
 		 431 aa  283  4.0000000000000003e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  39.5 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  33.64 
 
 		 431 aa  256  5e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  38.48 
 
 		 441 aa  253  6e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  27.62 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  26.52 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  23.89 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  31.19 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  26.26 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.48 
 
 		 567 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.04 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  26.54 
 
 		 483 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  27.3 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  27.12 
 
 		 466 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  25 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  25.51 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  25.51 
 
 		 467 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  23.12 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  24.42 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  24.42 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  24.42 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  24.42 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  24.42 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  24.42 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.21 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  25.22 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  31.16 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  26.56 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  37.96 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  37.96 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  21.04 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  23.55 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  37.96 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  37.96 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  31.28 
 
 		 567 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  29.75 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  36.5 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  25.35 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  31.55 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  30.04 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  37.5 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  37.5 
 
 		 522 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  35.03 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.53 
 
 		 571 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  34.67 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  29.53 
 
 		 571 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>