226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1914 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  100 
 
 
433 aa  846    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  86.84 
 
 
459 aa  734    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  86.84 
 
 
459 aa  734    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  59.53 
 
 
441 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  57.97 
 
 
438 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  57.97 
 
 
438 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  57.97 
 
 
438 aa  500  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  57.97 
 
 
438 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  57.97 
 
 
438 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  57.27 
 
 
438 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  56.78 
 
 
494 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  56.35 
 
 
438 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  57.04 
 
 
438 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  56.81 
 
 
493 aa  478  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  57.04 
 
 
438 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  50.12 
 
 
442 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  45.56 
 
 
439 aa  386  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  47.49 
 
 
438 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  49.53 
 
 
437 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  49.53 
 
 
437 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  46.7 
 
 
423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  44.16 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  44.58 
 
 
441 aa  329  7e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  45.29 
 
 
441 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  41.55 
 
 
434 aa  322  6e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  45.16 
 
 
437 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  44.05 
 
 
468 aa  319  5e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  41.78 
 
 
443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  41.15 
 
 
457 aa  305  7e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  40.9 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  40.29 
 
 
445 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  40.42 
 
 
444 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  41.82 
 
 
454 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  39.25 
 
 
445 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  39.25 
 
 
445 aa  300  5e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  39.25 
 
 
445 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  39.25 
 
 
445 aa  299  7e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  41.12 
 
 
444 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  39.65 
 
 
445 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  44.47 
 
 
440 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  41.12 
 
 
444 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  41.12 
 
 
444 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  40.89 
 
 
444 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  43.6 
 
 
441 aa  294  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  43.2 
 
 
455 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  41.75 
 
 
455 aa  292  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  41.01 
 
 
472 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  42.2 
 
 
447 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  40.54 
 
 
449 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  40.99 
 
 
447 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  39.37 
 
 
443 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  40.44 
 
 
425 aa  282  8.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  41.5 
 
 
443 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  39.23 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  38.74 
 
 
447 aa  272  1e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  40.34 
 
 
431 aa  271  2e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  32.77 
 
 
462 aa  224  3e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  33.49 
 
 
431 aa  223  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  28.72 
 
 
467 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  26.46 
 
 
473 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  22.83 
 
 
467 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  26.79 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.99 
 
 
482 aa  83.2  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  26.73 
 
 
484 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  25.3 
 
 
483 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  25.3 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  23.76 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  25.05 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  25.49 
 
 
470 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  25.77 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  24.09 
 
 
467 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  22.54 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  23.84 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0341  Na+/H+ antiporter NhaC  22.54 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.84 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  23.63 
 
 
473 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  23.84 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  23.63 
 
 
473 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  23.84 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  23.84 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  23.84 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  22.98 
 
 
473 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  23.84 
 
 
467 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  23.84 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  23.43 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  22.17 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  23.41 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  23.41 
 
 
473 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  23.68 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  24.47 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  22.97 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  23.33 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  23.9 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  23.9 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  23.36 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  26.34 
 
 
502 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  22.65 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  28.37 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4931  Na+/H+ antiporter NhaC  23.33 
 
 
473 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  24.44 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>