231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4165 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 468 aa  922    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  48.93 
 
 		 473 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  46.9 
 
 		 467 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  48.34 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2417  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.14 
 
 		 523 aa  213  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0614  Na+/H+ antiporter NhaC  30.79 
 
 		 518 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.101313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  28.23 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  28.23 
 
 		 483 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  28.24 
 
 		 470 aa  166  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  27.25 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  29.78 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  27.61 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  27.69 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  29.92 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  29.25 
 
 		 444 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  29.92 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  27.08 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  26.42 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  26.42 
 
 		 445 aa  97.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  28.97 
 
 		 444 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  27.1 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  26.43 
 
 		 472 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  26.45 
 
 		 447 aa  90.9  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  29.18 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  26.78 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  24.71 
 
 		 438 aa  87  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  24.82 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  24.82 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  24.82 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  24.82 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  24.82 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  26.11 
 
 		 455 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  26.4 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  23.82 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  26.74 
 
 		 454 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  25.34 
 
 		 494 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  24.36 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  23.91 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  24.81 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  24.82 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  25.8 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  24.1 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  25.81 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  24.06 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  24.06 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  25.66 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  24.36 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  22.75 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  24.2 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  22.83 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  30.23 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  25.18 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  22.03 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  28.37 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  29.44 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  25.45 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  28.52 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  24.88 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  23.8 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.24 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  26.41 
 
 		 455 aa  67  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  28.98 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03022  Na+/H+ antiporter  25.97 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  26.41 
 
 		 477 aa  66.6  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  24.39 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  29.88 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1622  Na+/H+ antiporter  28.37 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000132012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  35.94 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.94 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  39.13 
 
 		 521 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  29.95 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  30.92 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  34.39 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  28.35 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  32.32 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  30.77 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  31.72 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  26.32 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3531  Na+/H+ antiporter NhaC  29.86 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0661235 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  26.36 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  34.04 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2709  Na+/H+ antiporter NhaC  28.23 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  26.68 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  23.3 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  26.63 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  38.46 
 
 		 541 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  31.45 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  28.68 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  27.24 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  30.19 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  29.02 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  24.09 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0133  NahC family Na(+)/H(+) antiporter  25.81 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  27.68 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  29.87 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  29.87 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  27.51 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  37.59 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  27.51 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  29.69 
 
 		 467 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>