271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1884 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  66.53 
 
 		 493 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 457 aa  902    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  70.92 
 
 		 448 aa  608  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  51.1 
 
 		 451 aa  461  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  35.39 
 
 		 510 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  36.8 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  34.51 
 
 		 476 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  34.29 
 
 		 525 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  34.35 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  32.71 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  33.6 
 
 		 518 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  33.67 
 
 		 533 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  33.13 
 
 		 522 aa  232  9e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  32.92 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  32.92 
 
 		 522 aa  229  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  32.71 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  32.53 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  33.84 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  32.64 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  33.68 
 
 		 520 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  32.71 
 
 		 521 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  32.78 
 
 		 524 aa  217  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  30.29 
 
 		 515 aa  216  7e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  31.49 
 
 		 570 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  33.06 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  32.85 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  31.49 
 
 		 524 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  33.06 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  33.06 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  31.93 
 
 		 574 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  31.34 
 
 		 513 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  32.17 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  34.02 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  29.13 
 
 		 515 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  30.04 
 
 		 569 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  32.14 
 
 		 507 aa  206  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  31.65 
 
 		 528 aa  206  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.92 
 
 		 550 aa  206  9e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  31.43 
 
 		 533 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  31.13 
 
 		 527 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  30.93 
 
 		 533 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.47 
 
 		 567 aa  204  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  30.96 
 
 		 529 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  31.71 
 
 		 567 aa  201  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.18 
 
 		 571 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.82 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  30.18 
 
 		 571 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  31.71 
 
 		 521 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  30.6 
 
 		 532 aa  195  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.4 
 
 		 560 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  31.13 
 
 		 528 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  29.29 
 
 		 577 aa  192  7e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  30.94 
 
 		 526 aa  193  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  29.29 
 
 		 577 aa  192  8e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  29.29 
 
 		 577 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.53 
 
 		 556 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  29.91 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  29.96 
 
 		 629 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.11 
 
 		 564 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  31.4 
 
 		 546 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  29.11 
 
 		 541 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  29.31 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  30.08 
 
 		 504 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  26.89 
 
 		 587 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  32.7 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  29.39 
 
 		 525 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  31.39 
 
 		 507 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  32.7 
 
 		 497 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  32.7 
 
 		 497 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  29.58 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  32.08 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  27.87 
 
 		 561 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  31.12 
 
 		 501 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  28.84 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  29.17 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  28.69 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  28.69 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  28.69 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  27.1 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  28.06 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  28.48 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  28.48 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  30.66 
 
 		 501 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  29.68 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  29.84 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.6 
 
 		 594 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  28.57 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.18 
 
 		 638 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  29.44 
 
 		 493 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  28.27 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  28.27 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  28.06 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  31.74 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  28.86 
 
 		 460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  25.47 
 
 		 470 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  29.6 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  29.1 
 
 		 460 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  25.93 
 
 		 454 aa  152  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  29.85 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25.26 
 
 		 470 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>