269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01104 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  80.44 
 
 		 455 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 455 aa  901    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  68.97 
 
 		 447 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  60.24 
 
 		 443 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  58.2 
 
 		 445 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  58.89 
 
 		 457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  57.53 
 
 		 445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  57.53 
 
 		 445 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  57.3 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  57.53 
 
 		 445 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  59.82 
 
 		 454 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  58.33 
 
 		 444 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  59.33 
 
 		 445 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  58.11 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  59.67 
 
 		 472 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  58.11 
 
 		 444 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  57.88 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  59.95 
 
 		 447 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  58.04 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  53.29 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  55.67 
 
 		 443 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  56.25 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  48.01 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  48.52 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  54.59 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  53.24 
 
 		 440 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  51.82 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  46.21 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  44.22 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  45.87 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  44.3 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  43.88 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  43.21 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  43.43 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  44.12 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  44.12 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  44.12 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  44.12 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  43.3 
 
 		 493 aa  353  5e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  43.65 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  42.27 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  44.39 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  42.32 
 
 		 458 aa  325  8.000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  37.93 
 
 		 431 aa  315  7e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  38.57 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  40.52 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  41.36 
 
 		 459 aa  302  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  41.36 
 
 		 459 aa  302  8.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  40.41 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  40.41 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  40.74 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  41.44 
 
 		 441 aa  282  9e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  40.91 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  40.65 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  38.27 
 
 		 447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  37.47 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  36.75 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  34.68 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  27.76 
 
 		 473 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  25.13 
 
 		 457 aa  90.1  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  27.75 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  25.53 
 
 		 483 aa  87  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  25.53 
 
 		 470 aa  87  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  25.47 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  25.37 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  24.89 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  22.67 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  25.28 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  22.52 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.9 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  32.08 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  33.77 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  24.27 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  22.65 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  30.52 
 
 		 507 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  32.29 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  23.1 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  23.1 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0614  Na+/H+ antiporter NhaC  23.95 
 
 		 518 aa  73.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.101313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2457  Na+/H+ antiporter NhaC  24.08 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  31.61 
 
 		 201 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  22.06 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  21.08 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  32.77 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0177  Na+/H+ antiporter NhaC  25.39 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  31.88 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  24.11 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12548  Na+/H+ antiporter  34.09 
 
 		 501 aa  70.1  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.678652  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  35 
 
 		 517 aa  70.1  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  35.59 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  34.3 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  23.99 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1995  Na+/H+ antiporter NhaC  33.08 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00594855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4486  Na+/H+ antiporter NhaC  22.88 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  21.52 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0133  NahC family Na(+)/H(+) antiporter  30.91 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  35.25 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  30.3 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03793  Na+/H+ antiporter, NhaC family protein  28.82 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  30.53 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>