274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3178 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  86.97 
 
 		 445 aa  780    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  78.56 
 
 		 449 aa  640    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  87.39 
 
 		 472 aa  748    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  87.42 
 
 		 445 aa  781    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  88.57 
 
 		 454 aa  768    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  87.42 
 
 		 445 aa  781    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  86.94 
 
 		 444 aa  752    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  81.67 
 
 		 447 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  87.64 
 
 		 445 aa  781    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  89.46 
 
 		 457 aa  770    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  82.69 
 
 		 445 aa  701    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  86.94 
 
 		 444 aa  754    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  86.1 
 
 		 445 aa  753    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  86.94 
 
 		 444 aa  754    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  87.16 
 
 		 444 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 443 aa  870    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  62.74 
 
 		 455 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  61.1 
 
 		 455 aa  511  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  61.96 
 
 		 447 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  56.25 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  53.88 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  55.24 
 
 		 443 aa  440  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  57.49 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  52.5 
 
 		 468 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  52.88 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  47.2 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  46.37 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  46.14 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  44.37 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  44.16 
 
 		 494 aa  362  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  43.39 
 
 		 438 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  43.9 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  45.58 
 
 		 461 aa  360  2e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  45.73 
 
 		 441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  44.39 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  44.39 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  44.39 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  44.39 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  44.39 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  45.63 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  43.66 
 
 		 493 aa  350  4e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  43.66 
 
 		 438 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  43.54 
 
 		 458 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  39.3 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  43.51 
 
 		 431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  41.27 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  41.84 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  41.84 
 
 		 437 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  40.98 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  40.98 
 
 		 459 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  39.73 
 
 		 425 aa  300  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  40.9 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  43.58 
 
 		 423 aa  292  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  40.66 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  36.73 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  36.83 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  34.24 
 
 		 462 aa  259  7e-68  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  34.55 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  27.25 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  27.01 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  27.06 
 
 		 467 aa  97.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  26.96 
 
 		 457 aa  96.7  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  26.74 
 
 		 467 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  26.48 
 
 		 467 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  26.22 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  25.96 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  25.96 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  25.96 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  25.96 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  25.96 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  25.71 
 
 		 467 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  27.53 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  26.14 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  26.39 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  23.37 
 
 		 494 aa  90.9  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  23.45 
 
 		 488 aa  89.7  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  24.55 
 
 		 483 aa  88.6  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  24.21 
 
 		 470 aa  87.8  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  24.21 
 
 		 483 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  24.59 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  24.89 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  25.39 
 
 		 457 aa  87  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  25.39 
 
 		 457 aa  87  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  35.85 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  22.93 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  24.87 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  25.65 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  25.65 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  35.22 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  25.65 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4345  Na+/H+ antiporter NhaC  25.65 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  25.65 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  25.84 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  25.95 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  26.51 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  22.41 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  20.27 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  25.68 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  26.51 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  25.68 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>