228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2580 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 		 473 aa  933    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  78.28 
 
 		 467 aa  716    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  80.35 
 
 		 466 aa  670    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  48.93 
 
 		 468 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2417  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.44 
 
 		 523 aa  223  8e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0614  Na+/H+ antiporter NhaC  33.06 
 
 		 518 aa  209  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.101313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  31.06 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  31.06 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  30.98 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  27.38 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  24.8 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  24.8 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  24.8 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  24.8 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  24.8 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  25.2 
 
 		 494 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  27.76 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  24.53 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  24.53 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  24.53 
 
 		 438 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  24.8 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  24.8 
 
 		 493 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  29.23 
 
 		 443 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  26.3 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  27.16 
 
 		 437 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  27.27 
 
 		 437 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  27.57 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  26.55 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  27.4 
 
 		 458 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  25.13 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  27.15 
 
 		 445 aa  97.1  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  26.74 
 
 		 461 aa  96.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  27.23 
 
 		 442 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  26.73 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  26.5 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  26.52 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  26.52 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  26.52 
 
 		 445 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  26 
 
 		 445 aa  91.3  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  28.08 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  26.74 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  27.49 
 
 		 444 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  27.49 
 
 		 444 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  27.49 
 
 		 444 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  27.41 
 
 		 472 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  26.3 
 
 		 438 aa  88.6  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  26.79 
 
 		 444 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  25.56 
 
 		 441 aa  87  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  27 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  27.06 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  26.95 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  25.56 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  25 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  24.82 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  25.76 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  26.08 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  26.93 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  26.09 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  26.37 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  29.57 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  27.46 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  24.75 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  24.07 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  25.15 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  25.15 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  38.39 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  25.53 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  38.36 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  43.53 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  27.5 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  25.06 
 
 		 467 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  33.33 
 
 		 515 aa  67  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  36.36 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  25.57 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  25.57 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  25.23 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  25.23 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  25.11 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  25.23 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  25.23 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  25.23 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  24.16 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  43.68 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  25.23 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1622  Na+/H+ antiporter  28.32 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000132012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  33.59 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  31.46 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  39.13 
 
 		 521 aa  63.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2709  Na+/H+ antiporter NhaC  34.68 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  39.56 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  24.32 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  25.5 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  25.4 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  36.36 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  27.17 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  38.6 
 
 		 638 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  32.17 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  33.56 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  25.52 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  33.56 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>