275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0687 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  80.62 
 
 		 445 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  82.85 
 
 		 445 aa  709    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 449 aa  883    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  82.37 
 
 		 444 aa  696    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  82.14 
 
 		 444 aa  693    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  81.29 
 
 		 445 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  75.84 
 
 		 472 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  81.51 
 
 		 445 aa  715    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  81.47 
 
 		 447 aa  682    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  81.96 
 
 		 445 aa  717    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  76.72 
 
 		 457 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  75.5 
 
 		 445 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  82.37 
 
 		 444 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  77.56 
 
 		 454 aa  667    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  82.14 
 
 		 444 aa  692    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  78.56 
 
 		 443 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  60.27 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  58.93 
 
 		 455 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  59.36 
 
 		 455 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  53.1 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  52.13 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  53.33 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  54.65 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  46.37 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  46.67 
 
 		 438 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  50.62 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  52.54 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  45.41 
 
 		 434 aa  353  2e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  43.45 
 
 		 438 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  43.22 
 
 		 438 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  43.68 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  43.68 
 
 		 438 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  43.68 
 
 		 438 aa  349  7e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  43.68 
 
 		 438 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  43.68 
 
 		 438 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  43.74 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  45.23 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  42.24 
 
 		 441 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  43.3 
 
 		 461 aa  342  9e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  43.22 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  43.22 
 
 		 493 aa  339  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  42.11 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  43.79 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  41.83 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  40.05 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  37.18 
 
 		 431 aa  302  6.000000000000001e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  40.54 
 
 		 433 aa  299  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  39.86 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  41.11 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  41.11 
 
 		 437 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  39.86 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  39.75 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  41.45 
 
 		 423 aa  279  7e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  36.95 
 
 		 447 aa  279  8e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  40.25 
 
 		 441 aa  269  8.999999999999999e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  34.59 
 
 		 462 aa  266  5.999999999999999e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  35.44 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  33.48 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  26.35 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  26.35 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  26.35 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  28.38 
 
 		 473 aa  93.2  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  25.47 
 
 		 457 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  26.3 
 
 		 468 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  23.51 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  36.02 
 
 		 507 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  24.01 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  35.4 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  23.32 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  26.45 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  27.44 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  28.74 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  25.17 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  30.62 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  23.63 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  30.62 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  31.58 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  31.58 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  31.58 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  31.58 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  23.91 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  31.58 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  31.58 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  30.62 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  23.91 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.11 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  24.66 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  24.66 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  29.15 
 
 		 494 aa  76.6  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  24.06 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  32.08 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2457  Na+/H+ antiporter NhaC  23.48 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  30.42 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  30.32 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  27.65 
 
 		 587 aa  75.5  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.23 
 
 		 567 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  25.21 
 
 		 492 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  25.41 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  32.32 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  24.19 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>