266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3934 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  83.41 
 
 		 445 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  87.47 
 
 		 444 aa  743    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  85.55 
 
 		 444 aa  740    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  88.77 
 
 		 454 aa  784    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  84.3 
 
 		 445 aa  759    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 457 aa  903    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  84.3 
 
 		 445 aa  759    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  80.44 
 
 		 447 aa  697    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  83.86 
 
 		 445 aa  757    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  88.3 
 
 		 472 aa  760    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  84.75 
 
 		 445 aa  746    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  81.2 
 
 		 445 aa  690    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  85.55 
 
 		 444 aa  742    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  87.27 
 
 		 444 aa  743    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  89.46 
 
 		 443 aa  768    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  75.06 
 
 		 449 aa  628  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  59.85 
 
 		 455 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  60.32 
 
 		 455 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  58.61 
 
 		 447 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  54.44 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  54.13 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  57.01 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  52.94 
 
 		 443 aa  425  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  50.62 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  47.21 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  46.45 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  50.85 
 
 		 440 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  47.8 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  44.27 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  44.72 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  43.76 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  44.72 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  44.72 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  44.72 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  44.72 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  44.72 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  44.1 
 
 		 461 aa  362  6e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  46.7 
 
 		 441 aa  362  8e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  44.44 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  43.39 
 
 		 493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  44.27 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  42.07 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  41.86 
 
 		 431 aa  347  3e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  43.78 
 
 		 458 aa  337  2.9999999999999997e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  42.41 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  40.63 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  41.55 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  41.55 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  40.05 
 
 		 459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  40.05 
 
 		 459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  44.12 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  41.15 
 
 		 433 aa  295  8e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  41.62 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  37.56 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  35.09 
 
 		 447 aa  280  5e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  34.43 
 
 		 462 aa  272  1e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  35.14 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  33.79 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  28.23 
 
 		 457 aa  101  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  26.47 
 
 		 473 aa  97.8  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  27.69 
 
 		 468 aa  96.7  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  26.52 
 
 		 491 aa  94  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  26.65 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  24.38 
 
 		 470 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  24.48 
 
 		 483 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  24.38 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  27.02 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  23.11 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  24.22 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  26.58 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  23.96 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  26.58 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  24.44 
 
 		 467 aa  87  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  24.04 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  26.05 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  26.05 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  26.05 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.79 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  23.79 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  23.79 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  23.79 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  35.22 
 
 		 507 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  23.79 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.19 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  23.7 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  22.42 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  23.76 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  25.53 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4345  Na+/H+ antiporter NhaC  25.53 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  25.53 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  21.89 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  34.59 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  25.26 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  29.91 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  25.26 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  25.68 
 
 		 496 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  24.06 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  25.9 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  21.33 
 
 		 474 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  24.59 
 
 		 473 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>