263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2476 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 
441 aa  858    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  63.64 
 
 
440 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  64.1 
 
 
468 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  53.41 
 
 
445 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  52.95 
 
 
445 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  54.23 
 
 
445 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  53.18 
 
 
445 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  52.95 
 
 
445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  53.21 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  54.63 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  56.87 
 
 
455 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  53.64 
 
 
444 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  53.5 
 
 
454 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  53.64 
 
 
444 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  53.64 
 
 
444 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  53.64 
 
 
444 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  55.74 
 
 
437 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  53.05 
 
 
472 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  53.45 
 
 
455 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  52.86 
 
 
443 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  52.95 
 
 
447 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  55.16 
 
 
447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  49.09 
 
 
442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  50.11 
 
 
438 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  51.17 
 
 
449 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  49.76 
 
 
443 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  47.61 
 
 
441 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  49.64 
 
 
443 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  48.55 
 
 
434 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  47.92 
 
 
438 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  47.69 
 
 
438 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  47.45 
 
 
438 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  47.92 
 
 
438 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  47.92 
 
 
438 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  47.92 
 
 
438 aa  359  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  47.92 
 
 
438 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  47.92 
 
 
438 aa  359  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  47.69 
 
 
438 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  47.69 
 
 
493 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  46.64 
 
 
494 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  44.52 
 
 
431 aa  332  1e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  43.29 
 
 
458 aa  330  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  45.82 
 
 
459 aa  329  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  45.82 
 
 
459 aa  329  7e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  46.48 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  46.48 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  43.79 
 
 
439 aa  326  5e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  44.39 
 
 
461 aa  325  9e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  40.05 
 
 
431 aa  323  4e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  46.32 
 
 
433 aa  322  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  41.22 
 
 
441 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  46.02 
 
 
423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  44.86 
 
 
441 aa  290  4e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  39.71 
 
 
447 aa  281  2e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  40.35 
 
 
425 aa  272  9e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  39.73 
 
 
443 aa  259  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  39.96 
 
 
444 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  34.99 
 
 
462 aa  252  1e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  26.94 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  26.94 
 
 
483 aa  83.2  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  26.94 
 
 
470 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  34.83 
 
 
541 aa  80.1  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  21.52 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  29.6 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  25.37 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  34.04 
 
 
513 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  32.97 
 
 
507 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  24.23 
 
 
488 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  34.64 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  22.22 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  27.93 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  24.88 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1725  Na+/H+ antiporter NhaC  29.63 
 
 
482 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  31.28 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  29.34 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  33.73 
 
 
518 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2832  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 
496 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  25.06 
 
 
467 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  24.38 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  27.34 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  24.38 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  24.63 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  24.38 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  24.38 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  24.38 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  24.33 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  23.69 
 
 
491 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  23.31 
 
 
492 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  33.71 
 
 
482 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  31.19 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  24.09 
 
 
467 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  34.42 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  31.41 
 
 
571 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  35.62 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  31.5 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  23.56 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2006  Na+/H+ antiporter  29.94 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.16502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3226  Na+/H+ antiporter NhaC  23.85 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0133  NahC family Na(+)/H(+) antiporter  30.3 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>