294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01080 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  87.56 
 
 		 507 aa  352  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  49.19 
 
 		 571 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  49.19 
 
 		 571 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  41.92 
 
 		 513 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  47.02 
 
 		 510 aa  167  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  45.81 
 
 		 517 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  47.97 
 
 		 520 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  46.15 
 
 		 533 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  49.36 
 
 		 518 aa  145  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  50.33 
 
 		 569 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  45.51 
 
 		 525 aa  144  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  44.87 
 
 		 525 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  46.47 
 
 		 567 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  46.3 
 
 		 534 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  40.2 
 
 		 521 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  37.56 
 
 		 587 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  44 
 
 		 524 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  44.64 
 
 		 550 aa  139  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  45.86 
 
 		 567 aa  137  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  45.39 
 
 		 557 aa  137  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  40.1 
 
 		 526 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  40 
 
 		 393 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  43.83 
 
 		 521 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  44.1 
 
 		 520 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  41.01 
 
 		 521 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  41.3 
 
 		 533 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  42.08 
 
 		 529 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  43.03 
 
 		 533 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  43.4 
 
 		 522 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  43.4 
 
 		 522 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  43.4 
 
 		 522 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  43.4 
 
 		 522 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  43.92 
 
 		 524 aa  131  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  43.03 
 
 		 533 aa  131  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  44.23 
 
 		 466 aa  131  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  42.41 
 
 		 451 aa  130  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  37.17 
 
 		 515 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  43.12 
 
 		 522 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  43.12 
 
 		 522 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  43.12 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  40.61 
 
 		 570 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  42.57 
 
 		 522 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  39.61 
 
 		 493 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  40.83 
 
 		 577 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  42.54 
 
 		 527 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  40.83 
 
 		 577 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  40.83 
 
 		 577 aa  128  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  40.94 
 
 		 457 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  39.63 
 
 		 515 aa  126  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  38.38 
 
 		 526 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  40.46 
 
 		 541 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  41.14 
 
 		 528 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  39.39 
 
 		 574 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  39.88 
 
 		 528 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  42.04 
 
 		 521 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  41.21 
 
 		 552 aa  122  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  38.56 
 
 		 448 aa  121  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  37.71 
 
 		 564 aa  120  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  39.88 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  37.85 
 
 		 561 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  39.53 
 
 		 497 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  34.01 
 
 		 497 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  36.27 
 
 		 504 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  39.53 
 
 		 497 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  39.53 
 
 		 497 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  42.68 
 
 		 501 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  38.46 
 
 		 532 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  39.53 
 
 		 497 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  41.88 
 
 		 629 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  42.68 
 
 		 501 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  42.04 
 
 		 501 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  43.4 
 
 		 476 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  41.22 
 
 		 560 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  37.43 
 
 		 525 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  40 
 
 		 509 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  37.89 
 
 		 493 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  37.67 
 
 		 574 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  39.67 
 
 		 507 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  43.92 
 
 		 508 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  42.17 
 
 		 546 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  35.37 
 
 		 460 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  35.37 
 
 		 460 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  38.78 
 
 		 448 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  34.57 
 
 		 460 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  34.57 
 
 		 460 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  34.57 
 
 		 460 aa  99.4  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  34.57 
 
 		 460 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  34.57 
 
 		 460 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  37.06 
 
 		 454 aa  98.6  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  34.15 
 
 		 460 aa  98.6  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  33.54 
 
 		 459 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  33.54 
 
 		 460 aa  97.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  33.54 
 
 		 460 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  33.54 
 
 		 460 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  33.54 
 
 		 460 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  33.54 
 
 		 460 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  32.93 
 
 		 470 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  36.71 
 
 		 779 aa  95.1  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.85 
 
 		 501 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>