178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0600 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 		 470 aa  927    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 483 aa  956    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  99.79 
 
 		 483 aa  954    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  31.24 
 
 		 467 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  30.85 
 
 		 473 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  28.23 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  30.15 
 
 		 466 aa  160  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2417  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.35 
 
 		 523 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0614  Na+/H+ antiporter NhaC  27.84 
 
 		 518 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.101313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  26.84 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  25.45 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  26.39 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  25.21 
 
 		 454 aa  90.5  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  24.37 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  26.23 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  26.23 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  26.23 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  26.23 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  25.33 
 
 		 443 aa  86.7  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  24.77 
 
 		 443 aa  86.7  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  26.52 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  26.23 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  23.06 
 
 		 423 aa  86.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  26.52 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  26.52 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  26.52 
 
 		 444 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  24.37 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  25 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  24.31 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  24.31 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  24.31 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  24.68 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  25.37 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  24.8 
 
 		 455 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  24.43 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  25.64 
 
 		 494 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  24.89 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  26.03 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  26.02 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  23.83 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  24.89 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  26.53 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  27.69 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  24.88 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  27.83 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  26.34 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  24.13 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  26.7 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  25.18 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  25.61 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  26.76 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  26.76 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  24.93 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  25.41 
 
 		 455 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  24.22 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  23.09 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  24.26 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  28.48 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  26.14 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  30.88 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  30.88 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  30.88 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  30.88 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  30.88 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  30.88 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  24.09 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  23.35 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  26.76 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  26.54 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  24.7 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  30.05 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  30.05 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  24.76 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  24.76 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  29.56 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  23.7 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  29.9 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  23.21 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  26.87 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  26.18 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4931  Na+/H+ antiporter NhaC  29.25 
 
 		 473 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.312276  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  28.11 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0341  Na+/H+ antiporter NhaC  28.11 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  28.11 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  28.85 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  28.11 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  28.11 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  27.71 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  27.71 
 
 		 473 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  29.89 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  30.13 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1622  Na+/H+ antiporter  28.74 
 
 		 481 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03022  Na+/H+ antiporter  29.89 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  23.71 
 
 		 494 aa  54.3  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  27.14 
 
 		 458 aa  53.5  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3531  Na+/H+ antiporter NhaC  26.48 
 
 		 477 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0661235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  27.31 
 
 		 473 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  36.79 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0972  Na+/H+ antiporter NhaC  27.63 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000730047  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  30.09 
 
 		 507 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>