275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1022 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 439 aa  860    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  49.19 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  47.64 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  47.64 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  47.87 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  47.87 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  47.87 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  47.87 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  47.87 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  47.19 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  46.49 
 
 		 494 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  47.42 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  48.05 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  49.08 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  49.08 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  45.6 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  45.58 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  46.37 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  45.58 
 
 		 459 aa  375  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  46.01 
 
 		 433 aa  364  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  44.27 
 
 		 442 aa  359  5e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  45.31 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  44.24 
 
 		 434 aa  338  8e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  44.98 
 
 		 423 aa  332  8e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  41.5 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  41.27 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  41.27 
 
 		 445 aa  322  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  40.82 
 
 		 445 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  41.59 
 
 		 445 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  41.2 
 
 		 457 aa  319  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  43.02 
 
 		 461 aa  319  7.999999999999999e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  44.02 
 
 		 441 aa  318  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  41.03 
 
 		 443 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  42.05 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  41.95 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  42.05 
 
 		 444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  40.91 
 
 		 454 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  43.65 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  41.59 
 
 		 444 aa  308  9e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  40.42 
 
 		 445 aa  308  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  40.59 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  40.57 
 
 		 441 aa  302  9e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  40.28 
 
 		 447 aa  302  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  40.93 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  38.93 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  42.37 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  43.11 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  41.05 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  40.05 
 
 		 449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  42.7 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  40.61 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  38.39 
 
 		 447 aa  279  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  40.25 
 
 		 425 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  37.18 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  36.49 
 
 		 447 aa  267  2e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  38.02 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  32.65 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  32.54 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  28.26 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  27.08 
 
 		 483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  27.38 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  26.84 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  26.51 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  26.24 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  24.81 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  25.17 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0177  Na+/H+ antiporter NhaC  26.49 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  25.33 
 
 		 463 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  23.78 
 
 		 470 aa  99  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  24.87 
 
 		 488 aa  97.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  27.52 
 
 		 484 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  24.87 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  26.34 
 
 		 474 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  25.39 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  24.88 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  25.64 
 
 		 466 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3226  Na+/H+ antiporter NhaC  22.19 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  20.71 
 
 		 494 aa  86.7  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  25.45 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  25.9 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  22.63 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  25.99 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  23.87 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  23.62 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  22.38 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  23.09 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  23.62 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.09 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  23.09 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  23.09 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  23.86 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  23.09 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  23.37 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  22.87 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  24.87 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  22.09 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03022  Na+/H+ antiporter  28.72 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  25.17 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  28.37 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  23.73 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>