261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2476 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 502 aa  999    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0133  NahC family Na(+)/H(+) antiporter  67.63 
 
 		 496 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03793  Na+/H+ antiporter, NhaC family protein  64.33 
 
 		 495 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  64.72 
 
 		 484 aa  644    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  66.25 
 
 		 494 aa  677    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  68.04 
 
 		 496 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2832  Na+/H+ antiporter NhaC  69.48 
 
 		 496 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0548  Na+/H+ antiporter NhaC  55.3 
 
 		 510 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0362545  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  49.36 
 
 		 489 aa  463  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  41.65 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  41.65 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  41.23 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  41.23 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  41.23 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  41.01 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0341  Na+/H+ antiporter NhaC  41.01 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  42.09 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4931  Na+/H+ antiporter NhaC  42.44 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.312276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  42.67 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  42.39 
 
 		 509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.226086  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  41.07 
 
 		 472 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4486  Na+/H+ antiporter NhaC  40.17 
 
 		 514 aa  349  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  39.67 
 
 		 491 aa  345  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2457  Na+/H+ antiporter NhaC  37.85 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  38.12 
 
 		 509 aa  334  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  39.76 
 
 		 505 aa  333  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  42.62 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1995  Na+/H+ antiporter NhaC  40.62 
 
 		 506 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00594855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3226  Na+/H+ antiporter NhaC  41.01 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  39.92 
 
 		 492 aa  327  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0344  Na+/H+ antiporter NhaC  37.52 
 
 		 506 aa  323  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0490  Na+/H+ antiporter NhaC  37.4 
 
 		 499 aa  323  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  43.6 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  43.6 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  43.6 
 
 		 457 aa  323  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3405  Na+/H+ antiporter NhaC  38.48 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.190303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  40.56 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  40.45 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  42.89 
 
 		 457 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  42.89 
 
 		 457 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4345  Na+/H+ antiporter NhaC  42.89 
 
 		 457 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  42.89 
 
 		 457 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  42.89 
 
 		 457 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  42.89 
 
 		 457 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  42.89 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  37.15 
 
 		 474 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3531  Na+/H+ antiporter NhaC  37.47 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0661235 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  36.6 
 
 		 469 aa  303  6.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  37.76 
 
 		 482 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1725  Na+/H+ antiporter NhaC  37.01 
 
 		 482 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  35.76 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1622  Na+/H+ antiporter  37.31 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000132012  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2609  Na+/H+ antiporter NhaC  39.6 
 
 		 478 aa  295  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  38.39 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  35.56 
 
 		 477 aa  292  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0177  Na+/H+ antiporter NhaC  37.53 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03022  Na+/H+ antiporter  35.21 
 
 		 478 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12540  Na+ antiporter NhaC  38.5 
 
 		 475 aa  287  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.859822 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12548  Na+/H+ antiporter  38.85 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.678652  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4039  Na+/H+ antiporter NhaC  39.06 
 
 		 491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0273  Na+/H+ antiporter NhaC  39.11 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2552  Na+/H+ antiporter NhaC  38.22 
 
 		 463 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  34.9 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  36.32 
 
 		 502 aa  279  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  37.95 
 
 		 510 aa  279  9e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000509696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  35.27 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  35.27 
 
 		 467 aa  279  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  35.27 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  35.27 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  35.27 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  35.27 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  35.27 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  35.32 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  35.27 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  36.16 
 
 		 467 aa  276  5e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2296  Na+/H+ antiporter NhaC  39.12 
 
 		 487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1967  Na+/H+ antiporter NhaC  37.27 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1856  Na+/H+ antiporter NhaC  37.27 
 
 		 484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1609  Na+/H+ antiporter NhaC  37.69 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2709  Na+/H+ antiporter NhaC  37.21 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1670  Na+/H+ antiporter NhaC  36.85 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1733  Na+/H+ antiporter NhaC  36.85 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1668  Na+/H+ antiporter NhaC  37.69 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1787  Na+/H+ antiporter NhaC  37.69 
 
 		 483 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2651  Na+/H+ antiporter NhaC  35.79 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1609  sodium/proton antiporter  38.35 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0461  Na+/H+ antiporter NhaC  38.16 
 
 		 483 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3617  Na+/H+ antiporter NhaC  35.99 
 
 		 479 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  37.99 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  31.81 
 
 		 474 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  32.8 
 
 		 482 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  32.94 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0166  Na+/H+ antiporter NhaC  34.88 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  36.79 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  33.41 
 
 		 458 aa  248  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  32.44 
 
 		 470 aa  243  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2367  Na+/H+ antiporter NhaC  34 
 
 		 466 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2324  Na+/H+ antiporter NhaC  33.56 
 
 		 466 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1881  Na+/H+ antiporter NhaC  32.8 
 
 		 465 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  30.74 
 
 		 467 aa  226  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>