245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02395 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  100 
 
 		 423 aa  845    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  48.32 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  46.7 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  46.23 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  46.7 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  46.7 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  47.13 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  46.7 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  46.7 
 
 		 438 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  46.93 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  46.04 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  46.23 
 
 		 493 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  46.23 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  46.41 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  46.41 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  46.08 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  46.05 
 
 		 442 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  40.88 
 
 		 438 aa  338  8e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  44.26 
 
 		 439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  44.15 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  45.52 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  43.85 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  47.24 
 
 		 441 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  43.78 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  44.74 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  43.32 
 
 		 443 aa  306  7e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  43.12 
 
 		 445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  44.03 
 
 		 440 aa  299  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  42.56 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  43.48 
 
 		 445 aa  296  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  43.85 
 
 		 454 aa  295  8e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  42.33 
 
 		 445 aa  295  9e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  42.33 
 
 		 445 aa  295  9e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  43.75 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  42.33 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  42.33 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  43.19 
 
 		 468 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  42.22 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  42.08 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  43.77 
 
 		 434 aa  287  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  39.62 
 
 		 458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  43.12 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  43.12 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  43.12 
 
 		 444 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  42.86 
 
 		 447 aa  285  8e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  42.86 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  41.19 
 
 		 449 aa  276  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  39.04 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  39.07 
 
 		 444 aa  270  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  39.58 
 
 		 447 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  41.19 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  38.4 
 
 		 443 aa  265  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  40.98 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  39.39 
 
 		 447 aa  262  8.999999999999999e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  39.83 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  35.71 
 
 		 431 aa  240  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  34.2 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  37.94 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  26.48 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  26.53 
 
 		 484 aa  86.7  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0600  Na+/H+ antiporter NhaC  23.06 
 
 		 483 aa  86.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.058512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  23.06 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  23.06 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  24 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  24.26 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  24.57 
 
 		 482 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  23.81 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  23.3 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  24.04 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  24.72 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  21.39 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  23.81 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  23.81 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  23.58 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  23.58 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  23.58 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  23.58 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  23.58 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  23.38 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  23.44 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  24.12 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  23.17 
 
 		 457 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2609  Na+/H+ antiporter NhaC  25 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  23.83 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0548  Na+/H+ antiporter NhaC  27.64 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0362545  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  34.69 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  25.25 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  30.6 
 
 		 517 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  21.65 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  23.02 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  22.89 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  21.58 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  28.57 
 
 		 510 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.91 
 
 		 567 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2709  Na+/H+ antiporter NhaC  22.05 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  31.29 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  32 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  21.69 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  32.17 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>