261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0991 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0991  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 425 aa  841    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  43.67 
 
 		 442 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10113  Na+/H+ antiporter  44.88 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2454  Na+/H+ antiporter NhaC  43.67 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1578  Na+/H+ antiporter NhaC  44.27 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000332533  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0657  Na+/H+ antiporter family protein  39.86 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.228073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0924  Na+/H+ antiporter NhaC  41.1 
 
 		 445 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1357  Na+/H+ antiporter NhaC  41.53 
 
 		 438 aa  300  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000473106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0918  Na+/H+ antiporter NhaC  41.1 
 
 		 445 aa  295  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00150537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3854  Na+/H+ antiporter family protein  39.9 
 
 		 438 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019775  hitchhiker  0.00000000000623952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0919  Na+/H+ antiporter NhaC  41.1 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0324061  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0954  Na+/H+ antiporter NhaC  41.1 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0132294  normal  0.214654 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1490  Na+/H+ antiporter family protein  39.81 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1087  Na+/H+ antiporter family protein  40.6 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1155  Na+ antiporter NhaC  39.9 
 
 		 494 aa  292  9e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.886487  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3178  Na+/H+ antiporter NhaC  39.52 
 
 		 443 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1343  Na+/H+ antiporter family protein  40.14 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00263572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1316  Na+/H+ antiporter  40.14 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000333466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1452  Na+/H+ antiporter family protein  40.14 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000182986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1526  Na+/H+ antiporter family protein  40.14 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44537e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1317  Na+/H+ antiporter (NhaC)  40.14 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3934  Na+/H+ antiporter NhaC  37.29 
 
 		 457 aa  285  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1445  Na+/H+ antiporter NhaC  38.77 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.530014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1022  Na+/H+ antiporter NhaC  40.25 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000105643  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2394  Na+ antiporter NhaC  39.57 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2351  Na+/H+ antiporter NhaC  39.57 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2242  Na+/H+ antiporter NhaC  41.22 
 
 		 461 aa  282  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.49641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3581  Na+/H+ antiporter NhaC  41 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01870  Na+/H+ antiporter  40.67 
 
 		 458 aa  280  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3384  Na+/H+ antiporter NhaC  41.06 
 
 		 444 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0903  Na+/H+ antiporter NhaC  41.06 
 
 		 444 aa  279  8e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0106925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1557  Na+/H+ antiporter family protein  40.14 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000408774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1596  Na+/H+ antiporter family protein  40.14 
 
 		 438 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3460  Na+/H+ antiporter NhaC  40.55 
 
 		 444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0130297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0677  Na+/H+ antiporter NhaC  39.55 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3871  Na+/H+ antiporter NhaC  37.56 
 
 		 454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2935  Na+/H+ antiporter family protein  38.97 
 
 		 445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0881293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1376  Na+/H+ antiporter NhaC  40.16 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  41.29 
 
 		 455 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0570  Na+/H+ antiporter NhaC  40.1 
 
 		 447 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2476  Na+/H+ antiporter family protein  40.35 
 
 		 441 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1914  Na+/H+ antiporter, putative  39.39 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2617  Na+/H+ antiporter family protein  39.74 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2303  Na(+)/H(+) antiporter family protein  39.74 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0135689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0687  Na+/H+ antiporter NhaC  38.8 
 
 		 449 aa  262  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004320  methionine transporter MetT  40.69 
 
 		 455 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1194  Na+/H+ antiporter NhaC  38.81 
 
 		 440 aa  259  7e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.453429  decreased coverage  0.00097014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3062  Na+/H+ antiporter NhaC  38.74 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.537719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16480  Na+/H+ antiporter  35.02 
 
 		 443 aa  245  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55815  normal  0.761105 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3465  Na+/H+ antiporter family protein  36.54 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0575071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0993  Na+ antiporter NhaC  36.54 
 
 		 437 aa  243  6e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0758  Na+/H+ antiporter NhaC  34.94 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0316  Na+/H+ antiporter family protein  38.06 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1083  putative Na+/H+ antiporter  38.4 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1247  Na+/H+ antiporter NhaC  36.15 
 
 		 441 aa  229  5e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02395  NA+/H+ antiporter NHAC  38.53 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0658  Na+/H+ antiporter  31.98 
 
 		 462 aa  209  6e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0407  Na+/H+ antiporter, putative  30.33 
 
 		 431 aa  204  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.56 
 
 		 567 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  24.28 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2580  Na+/H+ antiporter family protein  25.83 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263044  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  33.15 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  24.64 
 
 		 467 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4165  Na+/H+ antiporter NhaC  23.83 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  33.11 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  24.64 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  24.64 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.78 
 
 		 567 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  24.07 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  24.07 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  24.07 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  24.29 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  22.07 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  25.13 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  33.53 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0340  Na+/H+ antiporter NhaC  27.37 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.307313  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  29.27 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  33.53 
 
 		 571 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  32.12 
 
 		 587 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  31.17 
 
 		 507 aa  71.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0755  Na+/H+ antiporter family protein  25.23 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  32.14 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  25.97 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  30.52 
 
 		 201 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  26.78 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.54 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0605  Na+/H+ antiporter NhaC  32.31 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  28.06 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  31.91 
 
 		 570 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  25.67 
 
 		 470 aa  66.6  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0539  Na+/H+ antiporter family protein  23.76 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  32.37 
 
 		 526 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  32.19 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  30.87 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  28.74 
 
 		 533 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1057  Na+/H+ antiporter family protein  23.21 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  0.112252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  35.43 
 
 		 521 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>