270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1377 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
541 aa  1068    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  53.56 
 
 
564 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  54.87 
 
 
561 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  54.19 
 
 
556 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  50.37 
 
 
560 aa  512  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  47.4 
 
 
594 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  45.02 
 
 
515 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  41.18 
 
 
504 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  38.7 
 
 
521 aa  330  4e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  39.88 
 
 
567 aa  311  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  37.82 
 
 
569 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  37.68 
 
 
510 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  34.54 
 
 
513 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  40.21 
 
 
517 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  37.38 
 
 
567 aa  288  2e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  36.45 
 
 
577 aa  286  9e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  38.05 
 
 
520 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  36.26 
 
 
577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  36.26 
 
 
577 aa  283  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  37.81 
 
 
629 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  34.48 
 
 
570 aa  278  2e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  34.6 
 
 
571 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.31 
 
 
638 aa  273  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.41 
 
 
571 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.77 
 
 
557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  37.35 
 
 
525 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  37 
 
 
525 aa  254  3e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.11 
 
 
550 aa  252  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  36.75 
 
 
533 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  34.77 
 
 
574 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  33.45 
 
 
587 aa  249  9e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  35.8 
 
 
522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  36.51 
 
 
533 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  36.18 
 
 
533 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  36.4 
 
 
522 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  36.03 
 
 
533 aa  240  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  36.4 
 
 
522 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  36.16 
 
 
526 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  35.94 
 
 
521 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  35.08 
 
 
524 aa  236  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  34.15 
 
 
528 aa  236  8e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  35.33 
 
 
534 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  33.02 
 
 
525 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  34.56 
 
 
528 aa  232  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  36.33 
 
 
521 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  32.07 
 
 
507 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  35.63 
 
 
518 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  36.14 
 
 
522 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  33.53 
 
 
532 aa  223  6e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  35.77 
 
 
524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  36.4 
 
 
520 aa  220  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  34.91 
 
 
522 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  34.46 
 
 
522 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  34.46 
 
 
522 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  34.46 
 
 
522 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  34.02 
 
 
529 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  33.81 
 
 
526 aa  207  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  32.31 
 
 
521 aa  207  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  32.79 
 
 
515 aa  206  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  30.33 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  32.24 
 
 
552 aa  201  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  32.59 
 
 
527 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  28.93 
 
 
779 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  35.28 
 
 
546 aa  196  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  31.94 
 
 
460 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  31.42 
 
 
460 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  29.66 
 
 
493 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  30.04 
 
 
460 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  30.45 
 
 
460 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  30.45 
 
 
460 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  30.45 
 
 
460 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  29.83 
 
 
459 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  30.45 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  30.45 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  31.29 
 
 
476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  31.22 
 
 
448 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  29.11 
 
 
457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  29.92 
 
 
460 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  29.92 
 
 
460 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  29.92 
 
 
460 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  31.24 
 
 
460 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  27.93 
 
 
454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  29.71 
 
 
448 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  29.58 
 
 
460 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  30.13 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  27.02 
 
 
466 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  27.54 
 
 
470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  28.93 
 
 
507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  28.4 
 
 
393 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  29.23 
 
 
508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  30.09 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12550  Na+/H+ antiporter  27.07 
 
 
480 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.507606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  29.98 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  28.91 
 
 
501 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  29.98 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  29.98 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  30.21 
 
 
497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  28.7 
 
 
501 aa  131  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  26.44 
 
 
497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>