274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4723 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  100 
 
 		 493 aa  984    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  66.53 
 
 		 457 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  65.01 
 
 		 448 aa  599  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  48.88 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  35.43 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  35.26 
 
 		 510 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  33.94 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  32.76 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  32.95 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  33.14 
 
 		 525 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  31.72 
 
 		 557 aa  226  9e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  31.56 
 
 		 517 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  30.52 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.33 
 
 		 567 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  30.74 
 
 		 518 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  32.3 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  30.33 
 
 		 526 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  29.78 
 
 		 515 aa  215  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  29.02 
 
 		 521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  29.77 
 
 		 570 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  29.86 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  29.61 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  29.67 
 
 		 522 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  29.49 
 
 		 513 aa  209  7e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  30.57 
 
 		 574 aa  209  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  29.94 
 
 		 522 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  30.59 
 
 		 528 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  31.37 
 
 		 520 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  32.35 
 
 		 534 aa  205  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.41 
 
 		 550 aa  206  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  30.35 
 
 		 569 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  30.65 
 
 		 533 aa  203  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  30.8 
 
 		 567 aa  203  6e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  31.5 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  30.27 
 
 		 522 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  29.65 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  29.37 
 
 		 577 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  29.96 
 
 		 507 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  30.93 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.31 
 
 		 571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  28.87 
 
 		 587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  29.55 
 
 		 577 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  29.19 
 
 		 577 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  29.67 
 
 		 571 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  30.2 
 
 		 522 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  29.26 
 
 		 533 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  29.72 
 
 		 522 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  29.72 
 
 		 522 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  29.72 
 
 		 522 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  31.37 
 
 		 546 aa  194  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  29.38 
 
 		 533 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  29.66 
 
 		 527 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  30.1 
 
 		 629 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  30.31 
 
 		 526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  28.98 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  29.66 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  28.88 
 
 		 529 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  27.59 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  27.12 
 
 		 564 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  30.43 
 
 		 561 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  28.93 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  30.23 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  29.71 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  28.13 
 
 		 556 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  29.71 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  29.71 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  29.71 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  29.67 
 
 		 552 aa  179  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  28.96 
 
 		 525 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  29.3 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  29.51 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  29.51 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.38 
 
 		 560 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  28.48 
 
 		 460 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  29.7 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  28.34 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  28.34 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  28.34 
 
 		 460 aa  169  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.5 
 
 		 594 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  29.47 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  26.86 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  29.95 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.34 
 
 		 638 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  29.23 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  27.63 
 
 		 497 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 		 497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  29.32 
 
 		 497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  29.97 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  29.07 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  28.7 
 
 		 509 aa  150  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  28.07 
 
 		 501 aa  150  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  29.09 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  27.72 
 
 		 507 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  28.5 
 
 		 508 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  27.84 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  27.54 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  28.22 
 
 		 574 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.87 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  23.56 
 
 		 779 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>