197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2039 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  97.17 
 
 		 460 aa  896    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  96.09 
 
 		 460 aa  884    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 460 aa  915    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 460 aa  915    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  85.65 
 
 		 460 aa  789    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  96.09 
 
 		 460 aa  884    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  99.78 
 
 		 460 aa  912    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  86.74 
 
 		 460 aa  788    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  95.87 
 
 		 460 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  95.87 
 
 		 460 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  83.48 
 
 		 460 aa  763    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  84.78 
 
 		 460 aa  789    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  93.91 
 
 		 460 aa  870    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  74.19 
 
 		 459 aa  699    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  96.09 
 
 		 460 aa  884    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  53.78 
 
 		 448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  46.67 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17460  Na+/H+ antiporter  35.23 
 
 		 470 aa  280  6e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.701721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12550  Na+/H+ antiporter  34.48 
 
 		 480 aa  262  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.507606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  33.4 
 
 		 518 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  33.4 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  33.13 
 
 		 526 aa  227  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  33.13 
 
 		 525 aa  226  9e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  31.5 
 
 		 533 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  34.16 
 
 		 510 aa  224  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  30.8 
 
 		 574 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  32.08 
 
 		 522 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  32.73 
 
 		 525 aa  222  9e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  32.94 
 
 		 533 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  32.08 
 
 		 522 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  31.88 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  35.25 
 
 		 517 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  32.08 
 
 		 522 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  32.64 
 
 		 520 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  30.92 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  32.01 
 
 		 521 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  33.2 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.5 
 
 		 550 aa  219  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  32.08 
 
 		 524 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  31.44 
 
 		 528 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  32.66 
 
 		 528 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  32.4 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  32.21 
 
 		 534 aa  206  5e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  31.58 
 
 		 504 aa  206  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  31.73 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  31.01 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  32.21 
 
 		 522 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  31.42 
 
 		 522 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  31.42 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  30.4 
 
 		 532 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  31.01 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  31.42 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  32.26 
 
 		 526 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  29.36 
 
 		 570 aa  195  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  29.98 
 
 		 515 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.41 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  30.35 
 
 		 527 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  29.34 
 
 		 569 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  30.26 
 
 		 560 aa  193  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  30.64 
 
 		 552 aa  193  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  30.74 
 
 		 541 aa  192  9e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.6 
 
 		 571 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  30.31 
 
 		 507 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  29.8 
 
 		 571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  30.72 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  30.82 
 
 		 513 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  31.99 
 
 		 629 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  29.17 
 
 		 564 aa  186  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.56 
 
 		 567 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  29.16 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  29.12 
 
 		 515 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  28.71 
 
 		 557 aa  177  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  29.76 
 
 		 587 aa  176  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  29.09 
 
 		 567 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  29.8 
 
 		 561 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  29.76 
 
 		 529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  28.42 
 
 		 476 aa  169  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  27.97 
 
 		 451 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  29.02 
 
 		 577 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  28.84 
 
 		 577 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  29.88 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  28.69 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.88 
 
 		 594 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  28.52 
 
 		 577 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.93 
 
 		 638 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  31.96 
 
 		 546 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  25.56 
 
 		 779 aa  152  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  28.13 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  28.71 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  23.92 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  28.98 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  28.48 
 
 		 574 aa  134  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  26.45 
 
 		 466 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  28.3 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  27.33 
 
 		 509 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  27.87 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  28.3 
 
 		 497 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.9 
 
 		 501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25.93 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01078  Na+/H+ antiporter  33.73 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>