217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1405 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  60.55 
 
 
577 aa  676    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  100 
 
 
567 aa  1133    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  66.91 
 
 
557 aa  738    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  60.36 
 
 
577 aa  671    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  60 
 
 
577 aa  669    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  64.74 
 
 
570 aa  732    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  76.86 
 
 
567 aa  900    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  56.11 
 
 
569 aa  599  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  54.73 
 
 
571 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  54.55 
 
 
571 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  46.69 
 
 
587 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  41.38 
 
 
521 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  39.04 
 
 
629 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  38.54 
 
 
510 aa  341  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  38.66 
 
 
556 aa  327  5e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  35.71 
 
 
515 aa  322  9.000000000000001e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.09 
 
 
638 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.64 
 
 
564 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  34.92 
 
 
574 aa  312  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  37.94 
 
 
550 aa  310  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  37.13 
 
 
561 aa  306  6e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  36.87 
 
 
525 aa  302  9e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  37.38 
 
 
541 aa  302  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  36.65 
 
 
533 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  37.43 
 
 
520 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  35.97 
 
 
525 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  36.53 
 
 
517 aa  289  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  36.51 
 
 
526 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  36.13 
 
 
524 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  37.57 
 
 
521 aa  281  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  35.5 
 
 
513 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  33.93 
 
 
528 aa  280  5e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  36.56 
 
 
524 aa  276  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  34.94 
 
 
522 aa  276  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  34.75 
 
 
525 aa  274  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  35.12 
 
 
522 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  35.19 
 
 
522 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  35.17 
 
 
518 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  35.32 
 
 
528 aa  273  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  35.47 
 
 
533 aa  272  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  35.87 
 
 
522 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  37.28 
 
 
521 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  35.32 
 
 
520 aa  270  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  34.13 
 
 
504 aa  269  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.92 
 
 
560 aa  268  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  36.06 
 
 
507 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  34.94 
 
 
533 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  35.24 
 
 
529 aa  263  8e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  35.28 
 
 
534 aa  259  1e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  33.27 
 
 
532 aa  256  9e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  33.86 
 
 
533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  33.83 
 
 
521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  34.38 
 
 
527 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  32.96 
 
 
515 aa  250  4e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  35.56 
 
 
522 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  35.56 
 
 
522 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  35.56 
 
 
522 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  33.84 
 
 
522 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.86 
 
 
594 aa  246  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  33.33 
 
 
552 aa  246  6.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  34.46 
 
 
526 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  30.14 
 
 
779 aa  245  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  30.02 
 
 
451 aa  231  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  30.8 
 
 
476 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  30.8 
 
 
493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  31.71 
 
 
457 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  32.43 
 
 
546 aa  206  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  30.49 
 
 
459 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  29.91 
 
 
448 aa  183  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  29.09 
 
 
460 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  29.09 
 
 
460 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  29.15 
 
 
460 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  28.19 
 
 
460 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  28.52 
 
 
460 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  29.26 
 
 
393 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  30.06 
 
 
460 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  28.52 
 
 
460 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  28.52 
 
 
460 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  28.52 
 
 
460 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  28.52 
 
 
460 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  29.09 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  28.79 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  28.21 
 
 
460 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  29.23 
 
 
574 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.56 
 
 
501 aa  171  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  27.82 
 
 
466 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  26.64 
 
 
470 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  27.27 
 
 
454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  28.27 
 
 
460 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  26.21 
 
 
448 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  28.38 
 
 
509 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  26.2 
 
 
493 aa  150  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01078  Na+/H+ antiporter  34.17 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  25.91 
 
 
497 aa  148  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2551  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  26.48 
 
 
470 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  27.61 
 
 
497 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  27.17 
 
 
497 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  27.17 
 
 
497 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  27.83 
 
 
497 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  24.11 
 
 
507 aa  143  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>