254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2864 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
522 aa  1036    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  99.04 
 
 
522 aa  1030    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  80.43 
 
 
524 aa  839    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  76.3 
 
 
524 aa  813    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  89.85 
 
 
522 aa  944    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  99.81 
 
 
522 aa  1036    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  80.43 
 
 
521 aa  838    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  91.7 
 
 
522 aa  965    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  82.21 
 
 
526 aa  862    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  91.7 
 
 
522 aa  966    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  78.68 
 
 
518 aa  828    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  91.31 
 
 
522 aa  961    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  77.95 
 
 
520 aa  787    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  99.81 
 
 
522 aa  1036    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  80.89 
 
 
521 aa  865    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  55.95 
 
 
528 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  53.79 
 
 
533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  53.41 
 
 
533 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  53.82 
 
 
526 aa  552  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  53.6 
 
 
533 aa  554  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  54.92 
 
 
529 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  53.45 
 
 
521 aa  537  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  51.47 
 
 
527 aa  531  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  47.52 
 
 
515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  46 
 
 
520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  43.45 
 
 
546 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  44.29 
 
 
525 aa  356  6.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  44.18 
 
 
525 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  43.89 
 
 
533 aa  349  5e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  41.31 
 
 
574 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  39 
 
 
528 aa  326  8.000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  42.38 
 
 
534 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  39.12 
 
 
550 aa  316  7e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  38.65 
 
 
532 aa  307  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  38.56 
 
 
525 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  36.4 
 
 
515 aa  297  3e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  36.55 
 
 
510 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  36.24 
 
 
567 aa  288  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  38.92 
 
 
497 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  38.92 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  38.51 
 
 
497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  38.61 
 
 
497 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  35.48 
 
 
497 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  34.28 
 
 
552 aa  280  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  36.85 
 
 
507 aa  277  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.69 
 
 
557 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  34.69 
 
 
493 aa  269  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  35.37 
 
 
570 aa  268  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  36.04 
 
 
501 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  36.48 
 
 
501 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  37 
 
 
509 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  34.38 
 
 
504 aa  266  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  35.77 
 
 
569 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  37.29 
 
 
521 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.56 
 
 
571 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  34.5 
 
 
571 aa  264  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  35.74 
 
 
501 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  34.92 
 
 
517 aa  261  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.56 
 
 
567 aa  256  9e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  33.07 
 
 
513 aa  249  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142.2  Na(+)/H(+) antiporter  85.51 
 
 
138 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  36.83 
 
 
508 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  34.57 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  36.29 
 
 
561 aa  243  6e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  34.03 
 
 
577 aa  243  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  33.85 
 
 
507 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  37.13 
 
 
556 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  34.22 
 
 
577 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  33.78 
 
 
577 aa  239  9e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  36.44 
 
 
541 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  33.33 
 
 
587 aa  233  9e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  33.13 
 
 
457 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  32.53 
 
 
459 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  35.07 
 
 
629 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.14 
 
 
564 aa  226  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  32.02 
 
 
460 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  32.41 
 
 
460 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  32.41 
 
 
460 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  32.41 
 
 
460 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  32.41 
 
 
460 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  32.41 
 
 
460 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  33.97 
 
 
393 aa  219  8.999999999999998e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  31.33 
 
 
460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.13 
 
 
560 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  32.73 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  30.14 
 
 
493 aa  214  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  31.68 
 
 
460 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  31.68 
 
 
460 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  31.42 
 
 
460 aa  213  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  32.21 
 
 
460 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  32.06 
 
 
454 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  31.38 
 
 
460 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  31.23 
 
 
460 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.31 
 
 
638 aa  203  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  30.6 
 
 
460 aa  203  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  30.96 
 
 
466 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  28.84 
 
 
779 aa  193  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142.3  Na(+)/H(+) antiporter  81.67 
 
 
120 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  29.1 
 
 
448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  31.59 
 
 
448 aa  183  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>