214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1016 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  72.17 
 
 
526 aa  740    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1058    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  73.7 
 
 
527 aa  761    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  55.12 
 
 
522 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  54.92 
 
 
522 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  54.53 
 
 
522 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  55.51 
 
 
526 aa  549  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  54.35 
 
 
521 aa  548  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  55 
 
 
524 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  54.92 
 
 
522 aa  542  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  53.94 
 
 
524 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  53.68 
 
 
518 aa  537  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  55.32 
 
 
520 aa  537  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  53.19 
 
 
528 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  54.72 
 
 
521 aa  535  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  52.71 
 
 
533 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  51.64 
 
 
533 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  54.89 
 
 
522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  54.89 
 
 
522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  54.89 
 
 
522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  51.64 
 
 
533 aa  509  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  54.49 
 
 
522 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  51.76 
 
 
521 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  50.29 
 
 
515 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  44.14 
 
 
520 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  38.49 
 
 
574 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  40.73 
 
 
525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  40.2 
 
 
533 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  40.4 
 
 
525 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  41.62 
 
 
546 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.36 
 
 
550 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  39.92 
 
 
534 aa  300  6e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  34.54 
 
 
528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  35.71 
 
 
515 aa  280  6e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  35.09 
 
 
510 aa  279  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.15 
 
 
567 aa  278  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  35.42 
 
 
525 aa  273  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  36.11 
 
 
570 aa  272  9e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  36.65 
 
 
569 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.2 
 
 
557 aa  269  8.999999999999999e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  36.93 
 
 
532 aa  269  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  36.6 
 
 
497 aa  266  8e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  35.8 
 
 
507 aa  263  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.24 
 
 
567 aa  263  8e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  37.45 
 
 
501 aa  259  8e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  36.33 
 
 
517 aa  257  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  35.5 
 
 
521 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  33.79 
 
 
571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  33.79 
 
 
571 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  37.66 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  37.45 
 
 
501 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  35.4 
 
 
493 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  36.93 
 
 
497 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  36.93 
 
 
497 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  36.65 
 
 
497 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  36.98 
 
 
509 aa  248  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  37.15 
 
 
497 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  33.27 
 
 
577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  34.37 
 
 
507 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  33.15 
 
 
552 aa  239  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  33.15 
 
 
577 aa  239  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  34.08 
 
 
504 aa  240  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  35.61 
 
 
508 aa  239  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  32.58 
 
 
577 aa  239  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  32.82 
 
 
513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  33.87 
 
 
476 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  32.32 
 
 
587 aa  226  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  34.02 
 
 
541 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.72 
 
 
556 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  35.12 
 
 
629 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  32.57 
 
 
451 aa  217  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  30.96 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  35.47 
 
 
561 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.32 
 
 
564 aa  213  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  28.88 
 
 
493 aa  202  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  32.54 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.13 
 
 
638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  32.16 
 
 
448 aa  197  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.65 
 
 
560 aa  196  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  30.89 
 
 
459 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.58 
 
 
594 aa  194  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  27.11 
 
 
779 aa  186  8e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  29.77 
 
 
448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  30.44 
 
 
460 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  30.44 
 
 
460 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  30.44 
 
 
460 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  30.44 
 
 
460 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  30.46 
 
 
460 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  30.44 
 
 
460 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  29.92 
 
 
460 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  30.16 
 
 
460 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  30.26 
 
 
460 aa  176  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  28.99 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  29.66 
 
 
460 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  29.66 
 
 
460 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  29.66 
 
 
460 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  29.55 
 
 
460 aa  171  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  29.34 
 
 
460 aa  166  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142.2  Na(+)/H(+) antiporter  55.8 
 
 
138 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  27.97 
 
 
454 aa  164  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>