226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2144 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  78.29 
 
 		 533 aa  815    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  100 
 
 		 528 aa  1055    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  78.48 
 
 		 533 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  70.55 
 
 		 521 aa  746    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  73.85 
 
 		 533 aa  778    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  57.98 
 
 		 526 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  55.43 
 
 		 522 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  55.24 
 
 		 522 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  56.84 
 
 		 524 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  56.61 
 
 		 522 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  55.41 
 
 		 518 aa  579  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  57.09 
 
 		 524 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  54.91 
 
 		 521 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  56.03 
 
 		 522 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  56.42 
 
 		 521 aa  555  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  57.49 
 
 		 522 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  53.63 
 
 		 520 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  57.49 
 
 		 522 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  57.49 
 
 		 522 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  56.69 
 
 		 522 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  52.83 
 
 		 515 aa  532  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  52.08 
 
 		 526 aa  529  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  52.91 
 
 		 527 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  53.19 
 
 		 529 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  43.19 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  44.98 
 
 		 525 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  44.4 
 
 		 525 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  44.02 
 
 		 533 aa  359  9e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  43.74 
 
 		 546 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  41.9 
 
 		 574 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  42.63 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  36.64 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  39.27 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  37.83 
 
 		 525 aa  300  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  37.61 
 
 		 552 aa  292  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  36.35 
 
 		 567 aa  291  3e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  37 
 
 		 550 aa  290  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  37.25 
 
 		 515 aa  287  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  35.27 
 
 		 510 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.88 
 
 		 557 aa  278  1e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  37.09 
 
 		 532 aa  278  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  33.2 
 
 		 493 aa  276  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  33.82 
 
 		 570 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  36.44 
 
 		 569 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  34.28 
 
 		 497 aa  269  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  34.48 
 
 		 501 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  34.17 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  34.85 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  35.34 
 
 		 497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  35.13 
 
 		 497 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  35.09 
 
 		 521 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  34.27 
 
 		 501 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.32 
 
 		 567 aa  263  4e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  35.12 
 
 		 497 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.22 
 
 		 571 aa  263  8e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  35.03 
 
 		 571 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  34.7 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  35.19 
 
 		 497 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  33.61 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  36.66 
 
 		 629 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  33.92 
 
 		 507 aa  250  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  33.14 
 
 		 513 aa  250  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  32.63 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  32.85 
 
 		 587 aa  246  9e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.92 
 
 		 556 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  33.08 
 
 		 577 aa  240  4e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  32.9 
 
 		 577 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  32.9 
 
 		 577 aa  239  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  32.71 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  35.36 
 
 		 561 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.96 
 
 		 638 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  34.56 
 
 		 541 aa  232  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  34.27 
 
 		 476 aa  229  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  32.63 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.4 
 
 		 560 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.1 
 
 		 564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  33.33 
 
 		 459 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  33.2 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  33.2 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  33.2 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  33.2 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  33.2 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  32.67 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  32.67 
 
 		 460 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  30.59 
 
 		 493 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  32.6 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  31.65 
 
 		 457 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  32.53 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  31.85 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  31.85 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  31.59 
 
 		 460 aa  200  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  31.31 
 
 		 460 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  31.85 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.07 
 
 		 594 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  28.19 
 
 		 779 aa  196  9e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  31.42 
 
 		 448 aa  194  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  31.21 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  28.23 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  28.64 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  24.84 
 
 		 470 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>