223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0611 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1169    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  48.06 
 
 
567 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  48.4 
 
 
571 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  48.4 
 
 
571 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  48.52 
 
 
577 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  48.17 
 
 
577 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  47.83 
 
 
577 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  48.07 
 
 
557 aa  486  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  46.72 
 
 
570 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  46.99 
 
 
569 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  46.61 
 
 
567 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  40.18 
 
 
629 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  37.08 
 
 
510 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  38.45 
 
 
521 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  37.77 
 
 
515 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  36.95 
 
 
517 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.69 
 
 
550 aa  286  5.999999999999999e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  34.63 
 
 
561 aa  281  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.87 
 
 
638 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  34.27 
 
 
504 aa  270  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  33.8 
 
 
541 aa  264  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  33.63 
 
 
525 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  33.27 
 
 
525 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.47 
 
 
564 aa  259  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  33.1 
 
 
533 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  33.21 
 
 
528 aa  258  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  32.09 
 
 
507 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.95 
 
 
556 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  31.75 
 
 
515 aa  253  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  31.39 
 
 
520 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  32.54 
 
 
533 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  33.76 
 
 
522 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  33.58 
 
 
522 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  33.03 
 
 
522 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  30.85 
 
 
574 aa  248  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  33.27 
 
 
518 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  33.58 
 
 
522 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  32.25 
 
 
525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  33.27 
 
 
560 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  33.03 
 
 
533 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  32.28 
 
 
524 aa  240  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  29.11 
 
 
528 aa  239  9e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  32.71 
 
 
533 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  30.54 
 
 
532 aa  238  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  31.28 
 
 
526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  32.04 
 
 
521 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  32.23 
 
 
524 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  32.68 
 
 
520 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  30.97 
 
 
552 aa  231  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  30.18 
 
 
779 aa  230  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  32.67 
 
 
529 aa  228  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  33.39 
 
 
534 aa  226  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  32.71 
 
 
527 aa  226  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  32.44 
 
 
522 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  32.44 
 
 
522 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  32.44 
 
 
522 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  32.44 
 
 
522 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  31.27 
 
 
521 aa  223  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  31.22 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.45 
 
 
594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  28.6 
 
 
493 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  34.87 
 
 
546 aa  201  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  30.62 
 
 
526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  28.89 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  29.98 
 
 
476 aa  193  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  26.88 
 
 
457 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  29.26 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  29.26 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  29.26 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  29.26 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  29.26 
 
 
460 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  28.94 
 
 
460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  29.07 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  30.25 
 
 
513 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  28.89 
 
 
460 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  28.89 
 
 
460 aa  176  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  29.76 
 
 
466 aa  177  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  27.92 
 
 
393 aa  176  9e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  28.89 
 
 
460 aa  176  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  28.25 
 
 
460 aa  174  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  26.58 
 
 
574 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  28.12 
 
 
460 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  29.08 
 
 
460 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  27.53 
 
 
448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  27.12 
 
 
459 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  27.04 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  27.55 
 
 
454 aa  163  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  28.04 
 
 
448 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  26.26 
 
 
497 aa  160  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  27.03 
 
 
507 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  25.05 
 
 
497 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  24.86 
 
 
497 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  25.24 
 
 
497 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  25.69 
 
 
509 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  24.86 
 
 
497 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  25.71 
 
 
508 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  25.7 
 
 
493 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  24.24 
 
 
501 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  37.56 
 
 
201 aa  140  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  24.91 
 
 
470 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>