253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0897 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  97.52 
 
 
533 aa  973    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  97.14 
 
 
525 aa  970    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  78.71 
 
 
534 aa  744    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
525 aa  1022    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  47.15 
 
 
520 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  43.76 
 
 
574 aa  395  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  43.61 
 
 
533 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  44.98 
 
 
522 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  44.17 
 
 
521 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  44.78 
 
 
522 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  42.4 
 
 
518 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  43.68 
 
 
522 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  44.4 
 
 
528 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  45.51 
 
 
522 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  43.79 
 
 
533 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  44.58 
 
 
526 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  44.4 
 
 
533 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  43.31 
 
 
521 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  43.37 
 
 
524 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  42.18 
 
 
524 aa  365  1e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  42.48 
 
 
515 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  43 
 
 
521 aa  360  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  44.67 
 
 
520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  44.66 
 
 
522 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  44.51 
 
 
522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  44.14 
 
 
522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  44.14 
 
 
522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  40.77 
 
 
527 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  42.28 
 
 
528 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  41.4 
 
 
525 aa  337  2.9999999999999997e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  41.62 
 
 
526 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  40.73 
 
 
529 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  39.29 
 
 
510 aa  325  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  38.85 
 
 
567 aa  320  3e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  41.07 
 
 
546 aa  315  9e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  39.56 
 
 
532 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  38.76 
 
 
550 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  36.64 
 
 
515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  36.87 
 
 
567 aa  296  4e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  38.08 
 
 
557 aa  296  9e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.33 
 
 
556 aa  293  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  37.75 
 
 
552 aa  292  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  38.12 
 
 
571 aa  292  9e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  37.93 
 
 
571 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  38.76 
 
 
521 aa  282  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.46 
 
 
564 aa  281  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  36.54 
 
 
561 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  37.12 
 
 
569 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  37.9 
 
 
517 aa  273  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  34.99 
 
 
570 aa  270  5e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  35.71 
 
 
577 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  35.35 
 
 
577 aa  266  7e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  35.16 
 
 
577 aa  266  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.19 
 
 
560 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  37.83 
 
 
541 aa  263  6.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  33.45 
 
 
587 aa  263  8e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  35.56 
 
 
504 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  33.74 
 
 
513 aa  257  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  35.1 
 
 
457 aa  252  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  34.22 
 
 
507 aa  249  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.82 
 
 
594 aa  249  7e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  35.97 
 
 
629 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  33.33 
 
 
493 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  33.07 
 
 
476 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  32.14 
 
 
459 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  30.91 
 
 
451 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  33.93 
 
 
460 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  33.93 
 
 
460 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  33.93 
 
 
460 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  33.93 
 
 
460 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  33.93 
 
 
460 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  34.21 
 
 
466 aa  229  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  33.6 
 
 
460 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  33.07 
 
 
460 aa  226  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  32.54 
 
 
460 aa  225  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  33.4 
 
 
460 aa  225  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  33.73 
 
 
460 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  33.73 
 
 
460 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  33.73 
 
 
460 aa  223  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  34.86 
 
 
448 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  32.74 
 
 
460 aa  217  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  32.19 
 
 
507 aa  217  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  32.93 
 
 
460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  31.11 
 
 
509 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  31.66 
 
 
501 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.87 
 
 
638 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  30.52 
 
 
497 aa  206  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  30.52 
 
 
497 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  31.17 
 
 
501 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  32.14 
 
 
448 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  30.1 
 
 
497 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  30.24 
 
 
497 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  31.19 
 
 
454 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  31.31 
 
 
508 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  33.17 
 
 
393 aa  200  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  31.39 
 
 
501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  29.77 
 
 
493 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  30.95 
 
 
497 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  29.33 
 
 
779 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1623  Na+/H+ antiporter NhaC  26.88 
 
 
470 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>